data_6NNX

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
_pdbx_vrpt_database.code  6NNX
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_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   x-ray
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_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    6NNX
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2019-01-15
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         3
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2023-10-11
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2023-10-02:16:35
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,xtriage,eds,mogul,buster-report,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   Y
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer      "Cellular retinoic acid-binding protein 2"  
2  non-polymer  RETINAL  
3  water        water  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  2  
C  3  
#
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal        1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num  1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id      1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id  A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id   A
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_pdbx_vrpt_summary_diffraction.exp_method              x-ray
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.ordinal                 1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_estimate       29.688
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.I_over_sigma            2.17(1.87A)
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.num_miller_indices      16784
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L_mean   0.486
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L2_mean  0.318
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.twin_fraction           -h,-k,l:0.046
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_aniso          "[37.220,37.220,20.231,0.000,0.000,0.000]"
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_anisotropy         0.538
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.trans_NCS_details       "The largest off-origin peak in the Patterson function is 6.71% of the height of the origin peak. No significant pseudotranslation is detected."
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.acentric_outliers       0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.centric_outliers        0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_high     1.87
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_low      45.36
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_R                   0.21
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_Rfree               0.24
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
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_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_plane_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_torsion_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.ligand_of_interest
  1  1  1  A    1  PRO  A    1  .  ?        ?     ?     ?  ?     
  2  1  1  A    2  ASN  A    2  .  ?        ?     ?     ?  ?     
  3  1  1  A    3  PHE  A    3  .  ?        ?     ?     ?  ?     
  4  1  1  A    4  SER  A    4  .  ?        ?     ?     ?  ?     
  5  1  1  A    5  GLY  A    5  .  ?        ?     ?     ?  ?     
  6  1  1  A    6  ASN  A    6  .  ?        ?     ?     ?  ?     
  7  1  1  A    7  TRP  A    7  .  ?        ?     ?     ?  ?     
  8  1  1  A    8  LYS  A    8  .  ?        ?     ?     ?  ?     
  9  1  1  A    9  ILE  A    9  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 10  1  1  A   10  ILE  A   10  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 11  1  1  A   11  ARG  A   11  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 12  1  1  A   12  SER  A   12  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 13  1  1  A   13  GLU  A   13  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 14  1  1  A   14  ASN  A   14  A  ?        ?     ?     ?  ?     
 15  1  1  A   14  ASN  A   14  B  ?        ?     ?     ?  ?     
 16  1  1  A   15  PHE  A   15  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 17  1  1  A   16  GLU  A   16  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 18  1  1  A   17  GLU  A   17  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 19  1  1  A   18  LEU  A   18  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 20  1  1  A   19  LEU  A   19  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 21  1  1  A   20  LYS  A   20  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 22  1  1  A   21  VAL  A   21  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 23  1  1  A   22  LEU  A   22  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 24  1  1  A   23  GLY  A   23  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 25  1  1  A   24  VAL  A   24  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 26  1  1  A   25  ASN  A   25  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 27  1  1  A   26  VAL  A   26  A  ?        ?     ?     ?  ?     
 28  1  1  A   26  VAL  A   26  B  ?        ?     ?     ?  ?     
 29  1  1  A   27  MET  A   27  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 30  1  1  A   28  LEU  A   28  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 31  1  1  A   29  ARG  A   29  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 32  1  1  A   30  LYS  A   30  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 33  1  1  A   31  ILE  A   31  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 34  1  1  A   32  ALA  A   32  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 35  1  1  A   33  VAL  A   33  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 36  1  1  A   34  ALA  A   34  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 37  1  1  A   35  ALA  A   35  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 38  1  1  A   36  ALA  A   36  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 39  1  1  A   37  SER  A   37  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 40  1  1  A   38  LYS  A   38  .  ?        1     ?     ?  ?     
 41  1  1  A   39  TYR  A   39  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 42  1  1  A   40  ALA  A   40  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 43  1  1  A   41  VAL  A   41  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 44  1  1  A   42  GLU  A   42  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 45  1  1  A   43  ILE  A   43  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 46  1  1  A   44  LYS  A   44  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 47  1  1  A   45  GLN  A   45  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 48  1  1  A   46  GLU  A   46  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 49  1  1  A   47  GLY  A   47  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 50  1  1  A   48  ASP  A   48  A  ?        ?     ?     ?  ?     
 51  1  1  A   48  ASP  A   48  B  ?        ?     ?     ?  ?     
 52  1  1  A   49  THR  A   49  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 53  1  1  A   50  PHE  A   50  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 54  1  1  A   51  TYR  A   51  A  ?        ?     ?     ?  ?     
 55  1  1  A   51  TYR  A   51  B  ?        ?     ?     ?  ?     
 56  1  1  A   52  ILE  A   52  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 57  1  1  A   53  LYS  A   53  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 58  1  1  A   54  VAL  A   54  A  ?        ?     ?     ?  ?     
 59  1  1  A   54  VAL  A   54  B  ?        ?     ?     ?  ?     
 60  1  1  A   55  SER  A   55  A  ?        ?     ?     ?  ?     
 61  1  1  A   55  SER  A   55  B  ?        ?     ?     ?  ?     
 62  1  1  A   56  THR  A   56  A  ?        ?     ?     ?  ?     
 63  1  1  A   56  THR  A   56  B  ?        ?     ?     ?  ?     
 64  1  1  A   57  THR  A   57  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 65  1  1  A   58  VAL  A   58  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 66  1  1  A   59  TYR  A   59  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 67  1  1  A   60  THR  A   60  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 68  1  1  A   61  THR  A   61  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 69  1  1  A   62  GLU  A   62  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 70  1  1  A   63  ILE  A   63  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 71  1  1  A   64  ASN  A   64  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 72  1  1  A   65  PHE  A   65  .  ?        ?     ?     ?  ?     
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 74  1  1  A   66  LYS  A   66  B  ?        ?     ?     ?  ?     
 75  1  1  A   67  VAL  A   67  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 76  1  1  A   68  GLY  A   68  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 77  1  1  A   69  GLU  A   69  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 78  1  1  A   70  GLU  A   70  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 79  1  1  A   71  PHE  A   71  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 80  1  1  A   72  GLU  A   72  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 81  1  1  A   73  GLU  A   73  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 82  1  1  A   74  GLN  A   74  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 83  1  1  A   75  THR  A   75  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 84  1  1  A   76  VAL  A   76  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 85  1  1  A   77  ASP  A   77  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 86  1  1  A   78  GLY  A   78  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 87  1  1  A   79  ARG  A   79  A  ?        ?     ?     ?  ?     
 88  1  1  A   79  ARG  A   79  B  ?        ?     ?     ?  ?     
 89  1  1  A   80  PRO  A   80  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 90  1  1  A   81  CYS  A   81  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 91  1  1  A   82  LYS  A   82  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 92  1  1  A   83  SER  A   83  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 93  1  1  A   84  LEU  A   84  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 94  1  1  A   85  VAL  A   85  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 95  1  1  A   86  LYS  A   86  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 96  1  1  A   87  TRP  A   87  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 97  1  1  A   88  GLU  A   88  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 98  1  1  A   89  SER  A   89  .  ?        ?     ?     ?  ?     
 99  1  1  A   90  GLU  A   90  .  ?        ?     ?     ?  ?     
100  1  1  A   91  ASN  A   91  .  ?        ?     ?     ?  ?     
101  1  1  A   92  LYS  A   92  .  ?        ?     ?     ?  ?     
102  1  1  A   93  MET  A   93  .  ?        ?     ?     ?  ?     
103  1  1  A   94  VAL  A   94  A  ?        ?     ?     ?  ?     
104  1  1  A   94  VAL  A   94  B  ?        ?     ?     ?  ?     
105  1  1  A   95  CYS  A   95  .  ?        ?     ?     ?  ?     
106  1  1  A   96  GLU  A   96  .  ?        ?     ?     ?  ?     
107  1  1  A   97  GLN  A   97  .  ?        ?     ?     ?  ?     
108  1  1  A   98  LYS  A   98  .  ?        ?     ?     ?  ?     
109  1  1  A   99  LEU  A   99  .  ?        ?     ?     ?  ?     
110  1  1  A  100  LEU  A  100  .  ?        ?     ?     ?  ?     
111  1  1  A  101  LYS  A  101  .  ?        ?     ?     ?  ?     
112  1  1  A  102  GLY  A  102  .  ?        ?     ?     ?  ?     
113  1  1  A  103  GLU  A  103  .  ?        ?     ?     ?  ?     
114  1  1  A  104  GLY  A  104  .  ?        ?     ?     ?  ?     
115  1  1  A  105  PRO  A  105  .  ?        ?     ?     ?  ?     
116  1  1  A  106  LYS  A  106  .  ?        ?     ?     ?  ?     
117  1  1  A  107  THR  A  107  .  ?        ?     ?     ?  ?     
118  1  1  A  108  SER  A  108  .  ?        ?     ?     ?  ?     
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122  1  1  A  112  GLU  A  112  .  ?        ?     ?     ?  ?     
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124  1  1  A  114  THR  A  114  .  ?        ?     ?     ?  ?     
125  1  1  A  115  ASN  A  115  .  ?        ?     ?     ?  ?     
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3  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  N  
##
