data_1LAW

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
_pdbx_vrpt_database.code  1LAW
#
_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   x-ray
#
_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    1LAW
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         1993-05-10
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         5
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2024-02-14
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2024-02-03:16:12
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   N
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer  "RIBONUCLEASE H"  
2  water    water  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  2  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all  x-ray  
2  1.8  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore           
2  Ramachandran_outlier_percent  
3  rotamer_outliers_percent      
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1  18.89  141614     ?     ?  
2  2  1   8.23    6793  1.80  1.80  
3  1  2  11.70  138981     ?     ?  
4  2  2   2.97    6697  1.80  1.80  
5  1  3  21.29  138945     ?     ?  
6  2  3   8.39    6696  1.80  1.80  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A  11.70  
2  4  2  A  1  1  A   2.97  
3  5  3  A  1  1  A  21.29  
4  6  3  A  1  1  A   8.39  
#
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal          1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num    1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id        1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id    A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id     A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ      1.75
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ       0.96
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ   1267
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ  1711
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                        1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers  1.31
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_rotamer_outliers       5.51
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore                     13.02
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                   1218
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                 1267
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ                     0.96
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ                1711
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                    1.75
#
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.exp_method           x-ray
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.ordinal              1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_high  1.80
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_low   6.00
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_R                0.19
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
  1  1  1  A    1  MET  A    1  .  ?        ?     ?  
  2  1  1  A    2  LEU  A    2  .  ?        ?     ?  
  3  1  1  A    3  LYS  A    3  .  ?        ?     ?  
  4  1  1  A    4  GLN  A    4  .  ?        ?     ?  
  5  1  1  A    5  VAL  A    5  .  ?        ?     ?  
  6  1  1  A    6  GLU  A    6  .  ?        ?     ?  
  7  1  1  A    7  ILE  A    7  .  ?        ?     ?  
  8  1  1  A    8  PHE  A    8  .  ?        ?     ?  
  9  1  1  A    9  THR  A    9  .  ?        ?     2  
 10  1  1  A   10  ASP  A   10  .  ?        ?     ?  
 11  1  1  A   11  GLY  A   11  .  ?        ?     ?  
 12  1  1  A   12  SER  A   12  .  ?        ?     ?  
 13  1  1  A   13  CYS  A   13  .  ?        ?     ?  
 14  1  1  A   14  LEU  A   14  .  ?        ?     ?  
 15  1  1  A   15  GLY  A   15  .  ?        ?     ?  
 16  1  1  A   16  ASN  A   16  .  ?        ?     ?  
 17  1  1  A   17  PRO  A   17  .  ?        ?     ?  
 18  1  1  A   18  GLY  A   18  .  ?        ?     ?  
 19  1  1  A   19  PRO  A   19  .  ?        ?     ?  
 20  1  1  A   20  GLY  A   20  .  ?        ?     ?  
 21  1  1  A   21  GLY  A   21  .  ?        ?     ?  
 22  1  1  A   22  TYR  A   22  .  ?        ?     ?  
 23  1  1  A   23  GLY  A   23  .  ?        ?     ?  
 24  1  1  A   24  ALA  A   24  .  ?        ?     ?  
 25  1  1  A   25  ILE  A   25  .  ?        ?     ?  
 26  1  1  A   26  LEU  A   26  .  ?        ?     ?  
 27  1  1  A   27  ARG  A   27  .  ?        2     ?  
 28  1  1  A   28  TYR  A   28  .  ?        1     1  
 29  1  1  A   29  ARG  A   29  .  ?        2     ?  
 30  1  1  A   30  GLY  A   30  .  ?        ?     ?  
 31  1  1  A   31  ARG  A   31  .  ?        2     ?  
 32  1  1  A   32  GLU  A   32  .  ?        ?     ?  
 33  1  1  A   33  LYS  A   33  .  ?        ?     1  
 34  1  1  A   34  THR  A   34  .  ?        ?     ?  
 35  1  1  A   35  PHE  A   35  .  ?        ?     ?  
 36  1  1  A   36  SER  A   36  .  ?        ?     ?  
 37  1  1  A   37  ALA  A   37  .  ?        ?     ?  
 38  1  1  A   38  GLY  A   38  .  ?        ?     ?  
 39  1  1  A   39  TYR  A   39  .  ?        ?     ?  
 40  1  1  A   40  THR  A   40  .  ?        ?     ?  
 41  1  1  A   41  ARG  A   41  .  ?        ?     2  
 42  1  1  A   42  THR  A   42  .  ?        ?     ?  
 43  1  1  A   43  THR  A   43  .  ?        ?     ?  
 44  1  1  A   44  ASN  A   44  .  ?        ?     ?  
 45  1  1  A   45  ASN  A   45  .  ?        ?     ?  
 46  1  1  A   46  ARG  A   46  .  ?        3     ?  
 47  1  1  A   47  MET  A   47  .  ?        ?     ?  
 48  1  1  A   48  GLU  A   48  .  ?        2     ?  
 49  1  1  A   49  LEU  A   49  .  ?        ?     1  
 50  1  1  A   50  MET  A   50  .  ?        ?     ?  
 51  1  1  A   51  ALA  A   51  .  ?        ?     2  
 52  1  1  A   52  ALA  A   52  .  ?        ?     ?  
 53  1  1  A   53  ILE  A   53  .  ?        ?     1  
 54  1  1  A   54  VAL  A   54  .  ?        ?     ?  
 55  1  1  A   55  ALA  A   55  .  ?        ?     ?  
 56  1  1  A   56  LEU  A   56  .  ?        ?     ?  
 57  1  1  A   57  GLU  A   57  .  ?        ?     ?  
 58  1  1  A   58  ALA  A   58  .  ?        ?     ?  
 59  1  1  A   59  LEU  A   59  .  ?        ?     ?  
 60  1  1  A   60  LYS  A   60  .  ?        ?     2  
 61  1  1  A   61  GLU  A   61  .  ?        ?     ?  
 62  1  1  A   62  HIS  A   62  .  ?        ?     ?  
 63  1  1  A   63  CYS  A   63  .  ?        ?     3  
 64  1  1  A   64  GLU  A   64  .  ?        ?     1  
 65  1  1  A   65  VAL  A   65  .  ?        ?     1  
 66  1  1  A   66  ILE  A   66  .  ?        ?     1  
 67  1  1  A   67  LEU  A   67  .  ?        ?     1  
 68  1  1  A   68  SER  A   68  .  ?        ?     1  
 69  1  1  A   69  THR  A   69  .  ?        ?     ?  
 70  1  1  A   70  ASP  A   70  .  ?        ?     ?  
 71  1  1  A   71  SER  A   71  .  ?        ?     ?  
 72  1  1  A   72  GLN  A   72  .  ?        ?     ?  
 73  1  1  A   73  TYR  A   73  .  ?        ?     ?  
 74  1  1  A   74  ILE  A   74  .  ?        ?     ?  
 75  1  1  A   75  ARG  A   75  .  ?        ?     ?  
 76  1  1  A   76  GLN  A   76  .  ?        ?     ?  
 77  1  1  A   77  GLY  A   77  .  ?        ?     1  
 78  1  1  A   78  ILE  A   78  .  ?        ?     ?  
 79  1  1  A   79  THR  A   79  .  ?        ?     ?  
 80  1  1  A   80  GLN  A   80  .  ?        ?     ?  
 81  1  1  A   81  TRP  A   81  .  ?        ?     ?  
 82  1  1  A   82  ILE  A   82  .  ?        ?     ?  
 83  1  1  A   83  HIS  A   83  .  ?        ?     ?  
 84  1  1  A   84  ASN  A   84  .  ?        ?     ?  
 85  1  1  A   85  TRP  A   85  .  ?        ?     ?  
 86  1  1  A   86  LYS  A   86  .  ?        ?     ?  
 87  1  1  A   87  LYS  A   87  .  ?        ?     ?  
 88  1  1  A   88  ARG  A   88  .  ?        ?     ?  
 89  1  1  A   89  GLY  A   89  .  ?        ?     ?  
 90  1  1  A   90  TRP  A   90  .  ?        ?     ?  
 91  1  1  A   91  LYS  A   91  .  ?        ?     1  
 92  1  1  A   92  THR  A   92  .  ?        ?     ?  
 93  1  1  A   93  ALA  A   93  .  ?        ?     ?  
 94  1  1  A   94  ASP  A   94  .  ?        ?     ?  
 95  1  1  A   95  LYS  A   95  .  ?        ?     ?  
 96  1  1  A   96  LYS  A   96  .  ?        ?     ?  
 97  1  1  A   97  PRO  A   97  .  ?        ?     ?  
 98  1  1  A   98  VAL  A   98  .  ?        ?     ?  
 99  1  1  A   99  LYS  A   99  .  ?        ?     ?  
100  1  1  A  100  ASN  A  100  .  ?        ?     ?  
101  1  1  A  101  VAL  A  101  .  ?        ?     ?  
102  1  1  A  102  ASP  A  102  .  ?        ?     1  
103  1  1  A  103  LEU  A  103  .  ?        ?     ?  
104  1  1  A  104  TRP  A  104  .  ?        ?     1  
105  1  1  A  105  GLN  A  105  .  ?        ?     ?  
106  1  1  A  106  ARG  A  106  .  ?        3     1  
107  1  1  A  107  LEU  A  107  .  ?        ?     ?  
108  1  1  A  108  ASP  A  108  .  ?        ?     ?  
109  1  1  A  109  ALA  A  109  .  ?        ?     ?  
110  1  1  A  110  ALA  A  110  .  ?        ?     ?  
111  1  1  A  111  LEU  A  111  .  ?        ?     2  
112  1  1  A  112  GLY  A  112  .  ?        ?     ?  
113  1  1  A  113  GLN  A  113  .  ?        ?     ?  
114  1  1  A  114  HIS  A  114  .  ?        ?     3  
115  1  1  A  115  GLN  A  115  .  ?        1     ?  
116  1  1  A  116  ILE  A  116  .  ?        ?     2  
117  1  1  A  117  LYS  A  117  .  ?        ?     ?  
118  1  1  A  118  TRP  A  118  .  ?        ?     1  
119  1  1  A  119  GLU  A  119  .  ?        ?     1  
120  1  1  A  120  TRP  A  120  .  ?        ?     ?  
121  1  1  A  121  VAL  A  121  .  ?        ?     ?  
122  1  1  A  122  LYS  A  122  .  ?        ?     ?  
123  1  1  A  123  GLY  A  123  .  ?        ?     ?  
124  1  1  A  124  HIS  A  124  .  ?        ?     ?  
125  1  1  A  125  ALA  A  125  .  ?        ?     1  
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 17   17  Cg_endo   -87.6   164.2  Favored     ?  ?      7   8  0.70  11  1.14  molprobity  
 18   18  ?        -160.0   177.3  Favored     ?  ?      3   4  0.48   6  1.02  molprobity  
 19   19  Cg_endo   -70.8   129.7  Favored     ?  ?      7   8  0.93  11  0.84  molprobity  
 20   20  ?        -140.6  -178.4  Favored     ?  ?      3   4  1.19   5  1.72  molprobity  
 21   21  ?        -160.2   177.8  Favored     ?  ?      3   4  0.67   5  2.59  molprobity  
 22   22  p90      -140.7   162.2  Favored     ?  ?      9  13  0.97  18  1.70  molprobity  
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 26   26  tp       -122.8   120.3  Favored     ?  ?     11   8  0.69  11  1.15  molprobity  
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 29   29  mmm-85     69.4  -110.2  Allowed     ?  ?     13  11  1.38  14  4.00  molprobity  
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 50   50  tpp       -64.6   -32.6  Favored     ?  ?      9   8  0.88  10  1.25  molprobity  
 51   51  ?         -61.2   -52.8  Favored     ?  ?      5   5  0.40   7  2.23  molprobity  
 52   52  ?         -61.7   -45.5  Favored     ?  ?      5   5  1.11   7  1.21  molprobity  
 53   53  mt        -56.0   -60.8  Allowed     ?  ?     11   8  1.43  11  1.00  molprobity  
 54   54  t         -54.3   -40.6  Favored     ?  ?      9   7  1.19  10  2.27  molprobity  
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 62   62  m-70      -68.9   127.6  Favored     ?  ?      7  11  0.69  15  1.22  molprobity  
 63   63  m        -122.2   168.1  Favored     ?  ?      5   6  0.53   8  1.04  molprobity  
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 70   70  p-10     -107.8     8.1  Favored     ?  ?      4   8  0.80  11  1.93  molprobity  
 71   71  t         -71.9   123.0  Favored     ?  ?      5   6  1.54   8  1.60  molprobity  
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 78   78  mm        -62.2   -38.4  Favored     ?  ?     11   8  0.94  11  1.07  molprobity  
 79   79  p         -92.7   -25.7  Favored     ?  ?      7   7  1.09  10  1.25  molprobity  
 80   80  mt-30    -123.9   -32.5  Favored     ?  ?      8   9  0.74  12  1.61  molprobity  
 81   81  m0        -97.5   -54.9  Favored     ?  ?     10  16  0.68  23  1.28  molprobity  
 82   82  tt        -42.8   -42.1  Allowed     ?  ?     11   8  0.79  11  1.50  molprobity  
 83   83  t60       -58.6   -54.8  Favored     ?  ?      7  11  0.48  15  1.03  molprobity  
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 89   89  ?          65.7    30.3  Favored     ?  ?      3   4  0.85   5  1.05  molprobity  
 90   90  m95        60.5    46.8  Favored     ?  ?     10  16  0.64  23  1.53  molprobity  
 91   91  mttt     -132.9   152.8  Favored     ?  ?     13   9  1.14  11  2.01  molprobity  
 92   92  p         -78.1   169.5  Favored     ?  ?      7   7  1.26  10  1.77  molprobity  
 93   93  ?         -53.0   -37.3  Favored     ?  ?      5   5  0.59   7  0.94  molprobity  
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 95   95  mmtm       58.6    26.4  Favored     ?  ?     13   9  0.96  11  1.13  molprobity  
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 98   98  m         -65.3   156.7  Favored     ?  ?      9   7  0.85  10  1.89  molprobity  
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101  101  p         -52.6   -29.8  Favored     ?  ?      9   7  0.80  10  1.71  molprobity  
102  102  p-10      -61.1   -50.5  Favored     ?  ?      4   8  1.23  11  1.56  molprobity  
103  103  mt        -69.0   -46.5  Favored     ?  ?     11   8  0.61  11  1.23  molprobity  
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107  107  tp        -60.3   -46.8  Favored     ?  ?     11   8  0.50  11  0.68  molprobity  
108  108  t70       -51.6   -44.8  Favored     ?  ?      4   8  0.77  11  1.58  molprobity  
109  109  ?         -63.1   -39.5  Favored     ?  ?      5   5  1.33   7  2.14  molprobity  
110  110  ?         -71.9   -34.1  Favored     ?  ?      5   5  1.18   7  0.95  molprobity  
111  111  mt        -69.6   -40.9  Favored     ?  ?     11   8  0.51  11  0.71  molprobity  
112  112  ?         -69.7    -0.2  Favored     ?  ?      3   4  1.18   5  1.02  molprobity  
113  113  mm100     -98.5    -5.7  Favored     1  ?      8   9  0.61  12  1.59  molprobity  
114  114  m80      -139.7   174.4  Favored     1  ?      7  11  1.61  15  1.81  molprobity  
115  115  mt-30    -101.6   115.6  Favored     ?  ?      8   9  1.19  12  2.44  molprobity  
116  116  OUTLIER  -109.8   133.2  Favored     ?  ?     11   8  0.87  11  1.48  molprobity  
117  117  ttpt     -117.7   113.5  Favored     ?  ?     13   9  0.69  11  1.33  molprobity  
118  118  m95       -92.0   135.9  Favored     ?  ?     10  16  0.56  23  1.01  molprobity  
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120  120  m95       -84.8   109.2  Favored     ?  ?     10  16  0.64  23  0.91  molprobity  
121  121  m         -94.4   166.9  Allowed     ?  ?      9   7  0.83  10  1.29  molprobity  
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#
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#
loop_
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_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.link
 1   27  NE   CZ  NH1  126.096  120.300  0.500  11.59  ?     
 2   27  NE   CZ  NH2  115.724  120.300  0.500  -9.15  ?     
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20  153  C    N   CA   141.498  121.700  2.500   7.92  Y     
#
loop_
_pdbx_vrpt_software.ordinal
_pdbx_vrpt_software.name
_pdbx_vrpt_software.version
_pdbx_vrpt_software.success_y_or_n
1  molprobity   4.02b-467                                                             Y  
2  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  Y  
##
