data_7JIK

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
_pdbx_vrpt_database.code  7JIK
#
_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   x-ray
#
_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    7JIK
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2020-07-23
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         2
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2023-10-18
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2023-10-09:10:05
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,xtriage,eds,mogul,buster-report,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   N
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer      "Beta-2-glycoprotein 1"  
2  branched     alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose  
3  branched     2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose  
4  non-polymer  2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  2  
C  3  
D  4  
E  4  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all   x-ray  
2  2.69  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore           
2  Ramachandran_outlier_percent  
3  rotamer_outliers_percent      
4  RSRZ_outliers_percent         
5  R_value_R_free                
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
 1  1  1   33.09  141614     ?     ?  
 2  2  1   57.21    3122  2.70  2.70  
 3  1  2  100.00  138981     ?     ?  
 4  2  2  100.00    3069  2.70  2.70  
 5  1  3  100.00  138945     ?     ?  
 6  2  3  100.00    3069  2.70  2.70  
 7  1  4   78.63  127900     ?     ?  
 8  2  4   80.31    2737  2.70  2.70  
 9  1  5   46.99  130704     ?     ?  
10  2  5   79.68    2808  2.70  2.70  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A  100.00  
2  4  2  A  1  1  A  100.00  
3  5  3  A  1  1  A  100.00  
4  6  3  A  1  1  A  100.00  
5  7  4  A  1  1  A   78.63  
6  8  4  A  1  1  A   80.31  
#
loop_
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ
1  1  1  A  A  0.66  0.62  2569  3487  
2  1  2  B  B     ?     ?     ?     ?  
3  1  3  C  C     ?     ?     ?     ?  
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                        1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers  0.00
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_rotamer_outliers       0.00
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore                     8.57
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                   2521
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                 2569
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ                     0.62
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ                3487
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                    0.66
#
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.exp_method                x-ray
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.ordinal                   1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.bulk_solvent_b            53.752
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_estimate         78.821
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.I_over_sigma              1.12(2.69A)
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.num_miller_indices        43749
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.bulk_solvent_k            0.325
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L_mean     0.480
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L2_mean    0.311
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Fo_Fc_correlation         0.936
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_R                     0.22
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_Rfree                 0.24
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_R                     0.23
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_res_high              2.69
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_res_low               48.93
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_aniso            "[82.608,90.033,64.854,0.000,0.000,0.000]"
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_anisotropy           0.318
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.trans_NCS_details         "The largest off-origin peak in the Patterson function is 5.03% of the height of the origin peak. No significant pseudotranslation is detected."
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.B_factor_type             FULL
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.acentric_outliers         0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.centric_outliers          0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_completeness         99.71
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.number_reflns_R_free      2013
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.percent_free_reflections  4.60
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.percent_RSRZ_outliers     1.25
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_high       2.69
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_low        48.93
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_R                     0.22
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_Rfree                 0.24
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_torsion_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_ring_outliers
  1  1  1  A    1  GLY  A    1  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  2  1  1  A    2  ARG  A    2  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  3  1  1  A    3  THR  A    3  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  4  1  1  A    4  CYS  A    4  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  5  1  1  A    5  PRO  A    5  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  6  1  1  A    6  LYS  A    6  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  7  1  1  A    7  PRO  A    7  .  ?        2     ?     ?     ?     ?  
  8  1  1  A    8  ASP  A    8  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  9  1  1  A    9  ASP  A    9  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 10  1  1  A   10  LEU  A   10  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 11  1  1  A   11  PRO  A   11  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 12  1  1  A   12  PHE  A   12  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 13  1  1  A   13  SER  A   13  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 14  1  1  A   14  THR  A   14  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 15  1  1  A   15  VAL  A   15  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 16  1  1  A   16  VAL  A   16  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 17  1  1  A   17  PRO  A   17  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 18  1  1  A   18  LEU  A   18  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 19  1  1  A   19  LYS  A   19  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 20  1  1  A   20  THR  A   20  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 21  1  1  A   21  PHE  A   21  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 22  1  1  A   22  TYR  A   22  .  ?        2     ?     ?     ?     ?  
 23  1  1  A   23  GLU  A   23  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 24  1  1  A   24  PRO  A   24  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 25  1  1  A   25  GLY  A   25  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 26  1  1  A   26  GLU  A   26  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 27  1  1  A   27  GLU  A   27  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 28  1  1  A   28  ILE  A   28  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 29  1  1  A   29  THR  A   29  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 30  1  1  A   30  TYR  A   30  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 31  1  1  A   31  SER  A   31  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 32  1  1  A   32  CYS  A   32  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 33  1  1  A   33  LYS  A   33  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 34  1  1  A   34  PRO  A   34  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 35  1  1  A   35  GLY  A   35  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 36  1  1  A   36  TYR  A   36  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 37  1  1  A   37  VAL  A   37  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 38  1  1  A   38  SER  A   38  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
 39  1  1  A   39  ARG  A   39  .  ?        2     ?     ?     ?     ?  
 40  1  1  A   40  GLY  A   40  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 41  1  1  A   41  GLY  A   41  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 42  1  1  A   42  MET  A   42  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 43  1  1  A   43  ARG  A   43  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
 44  1  1  A   44  LYS  A   44  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 45  1  1  A   45  PHE  A   45  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 46  1  1  A   46  ILE  A   46  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 47  1  1  A   47  CYS  A   47  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 48  1  1  A   48  PRO  A   48  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 49  1  1  A   49  LEU  A   49  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 50  1  1  A   50  THR  A   50  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 51  1  1  A   51  GLY  A   51  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 52  1  1  A   52  LEU  A   52  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 53  1  1  A   53  TRP  A   53  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 54  1  1  A   54  PRO  A   54  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 55  1  1  A   55  ILE  A   55  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 56  1  1  A   56  ASN  A   56  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 57  1  1  A   57  THR  A   57  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
 58  1  1  A   58  LEU  A   58  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 59  1  1  A   59  LYS  A   59  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 60  1  1  A   60  CYS  A   60  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
 61  1  1  A   61  THR  A   61  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 62  1  1  A   62  PRO  A   62  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 63  1  1  A   63  ARG  A   63  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 64  1  1  A   64  VAL  A   64  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 65  1  1  A   65  CYS  A   65  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 66  1  1  A   66  PRO  A   66  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 67  1  1  A   67  PHE  A   67  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 68  1  1  A   68  ALA  A   68  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 69  1  1  A   69  GLY  A   69  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 70  1  1  A   70  ILE  A   70  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 71  1  1  A   71  LEU  A   71  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 72  1  1  A   72  GLU  A   72  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 73  1  1  A   73  ASN  A   73  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 74  1  1  A   74  GLY  A   74  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 75  1  1  A   75  ALA  A   75  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 76  1  1  A   76  VAL  A   76  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 77  1  1  A   77  ARG  A   77  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 78  1  1  A   78  TYR  A   78  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 79  1  1  A   79  THR  A   79  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 80  1  1  A   80  THR  A   80  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 81  1  1  A   81  PHE  A   81  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 82  1  1  A   82  GLU  A   82  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 83  1  1  A   83  TYR  A   83  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
 84  1  1  A   84  PRO  A   84  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 85  1  1  A   85  ASN  A   85  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 86  1  1  A   86  THR  A   86  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 87  1  1  A   87  ILE  A   87  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 88  1  1  A   88  SER  A   88  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 89  1  1  A   89  PHE  A   89  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 90  1  1  A   90  SER  A   90  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 91  1  1  A   91  CYS  A   91  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 92  1  1  A   92  ASN  A   92  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 93  1  1  A   93  THR  A   93  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 94  1  1  A   94  GLY  A   94  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 95  1  1  A   95  PHE  A   95  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 96  1  1  A   96  TYR  A   96  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 97  1  1  A   97  LEU  A   97  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 98  1  1  A   98  ASN  A   98  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 99  1  1  A   99  GLY  A   99  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
100  1  1  A  100  ALA  A  100  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
101  1  1  A  101  ASP  A  101  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
102  1  1  A  102  SER  A  102  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
103  1  1  A  103  ALA  A  103  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
104  1  1  A  104  LYS  A  104  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
105  1  1  A  105  CYS  A  105  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
106  1  1  A  106  THR  A  106  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
107  1  1  A  107  GLU  A  107  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
108  1  1  A  108  GLU  A  108  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
109  1  1  A  109  GLY  A  109  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
110  1  1  A  110  LYS  A  110  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
111  1  1  A  111  TRP  A  111  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
112  1  1  A  112  SER  A  112  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
113  1  1  A  113  PRO  A  113  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
114  1  1  A  114  GLU  A  114  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
115  1  1  A  115  LEU  A  115  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
116  1  1  A  116  PRO  A  116  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
117  1  1  A  117  VAL  A  117  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
118  1  1  A  118  CYS  A  118  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
119  1  1  A  119  ALA  A  119  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
120  1  1  A  120  PRO  A  120  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
121  1  1  A  121  ILE  A  121  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
122  1  1  A  122  ILE  A  122  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
123  1  1  A  123  CYS  A  123  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
124  1  1  A  124  PRO  A  124  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
125  1  1  A  125  PRO  A  125  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
126  1  1  A  126  PRO  A  126  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
127  1  1  A  127  SER  A  127  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
128  1  1  A  128  ILE  A  128  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
129  1  1  A  129  PRO  A  129  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
130  1  1  A  130  THR  A  130  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
131  1  1  A  131  PHE  A  131  .  ?        2     ?     ?     ?     ?  
132  1  1  A  132  ALA  A  132  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
133  1  1  A  133  THR  A  133  .  ?        3     ?     ?     ?     ?  
134  1  1  A  134  LEU  A  134  .  ?        4     ?     ?     ?     ?  
135  1  1  A  135  ARG  A  135  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
136  1  1  A  136  VAL  A  136  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
137  1  1  A  137  TYR  A  137  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
138  1  1  A  138  LYS  A  138  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
139  1  1  A  139  PRO  A  139  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
140  1  1  A  140  SER  A  140  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
141  1  1  A  141  ALA  A  141  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
142  1  1  A  142  GLY  A  142  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
143  1  1  A  143  ASN  A  143  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
144  1  1  A  144  ASN  A  144  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
145  1  1  A  145  SER  A  145  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
146  1  1  A  146  LEU  A  146  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
147  1  1  A  147  TYR  A  147  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
148  1  1  A  148  ARG  A  148  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
149  1  1  A  149  ASP  A  149  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
150  1  1  A  150  THR  A  150  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
151  1  1  A  151  ALA  A  151  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
152  1  1  A  152  VAL  A  152  .  ?        6     ?     ?     ?     ?  
153  1  1  A  153  PHE  A  153  .  ?        4     ?     ?     ?     ?  
154  1  1  A  154  GLU  A  154  .  ?        3     ?     ?     ?     ?  
155  1  1  A  155  CYS  A  155  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
156  1  1  A  156  LEU  A  156  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
157  1  1  A  157  PRO  A  157  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
158  1  1  A  158  GLN  A  158  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
159  1  1  A  159  HIS  A  159  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
160  1  1  A  160  ALA  A  160  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
161  1  1  A  161  MET  A  161  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
162  1  1  A  162  PHE  A  162  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
163  1  1  A  163  GLY  A  163  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
164  1  1  A  164  ASN  A  164  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
165  1  1  A  165  ASP  A  165  .  ?        3     ?     ?     ?     ?  
166  1  1  A  166  THR  A  166  .  ?        2     ?     ?     ?     ?  
167  1  1  A  167  ILE  A  167  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
168  1  1  A  168  THR  A  168  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
169  1  1  A  169  CYS  A  169  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
170  1  1  A  170  THR  A  170  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
171  1  1  A  171  THR  A  171  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
172  1  1  A  172  HIS  A  172  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
173  1  1  A  173  GLY  A  173  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
174  1  1  A  174  ASN  A  174  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
175  1  1  A  175  TRP  A  175  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
176  1  1  A  176  THR  A  176  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
177  1  1  A  177  LYS  A  177  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
178  1  1  A  178  LEU  A  178  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
179  1  1  A  179  PRO  A  179  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
180  1  1  A  180  GLU  A  180  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
181  1  1  A  181  CYS  A  181  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
182  1  1  A  182  ARG  A  182  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
183  1  1  A  183  GLU  A  183  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
184  1  1  A  184  VAL  A  184  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
185  1  1  A  185  LYS  A  185  .  ?        2     ?     ?     ?     ?  
186  1  1  A  186  CYS  A  186  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
187  1  1  A  187  PRO  A  187  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
188  1  1  A  188  PHE  A  188  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
189  1  1  A  189  PRO  A  189  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
190  1  1  A  190  SER  A  190  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
191  1  1  A  191  ARG  A  191  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
192  1  1  A  192  PRO  A  192  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
193  1  1  A  193  ASP  A  193  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
194  1  1  A  194  ASN  A  194  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
195  1  1  A  195  GLY  A  195  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
196  1  1  A  196  PHE  A  196  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
197  1  1  A  197  VAL  A  197  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
198  1  1  A  198  ASN  A  198  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
199  1  1  A  199  TYR  A  199  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
200  1  1  A  200  PRO  A  200  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
201  1  1  A  201  ALA  A  201  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
202  1  1  A  202  LYS  A  202  .  ?        3     ?     ?     ?     ?  
203  1  1  A  203  PRO  A  203  .  ?        2     ?     ?     ?     ?  
204  1  1  A  204  THR  A  204  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
205  1  1  A  205  LEU  A  205  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
206  1  1  A  206  TYR  A  206  .  ?        3     ?     ?     ?     ?  
207  1  1  A  207  TYR  A  207  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
208  1  1  A  208  LYS  A  208  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
209  1  1  A  209  ASP  A  209  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
210  1  1  A  210  LYS  A  210  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
211  1  1  A  211  ALA  A  211  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
212  1  1  A  212  THR  A  212  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
213  1  1  A  213  PHE  A  213  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
214  1  1  A  214  GLY  A  214  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
215  1  1  A  215  CYS  A  215  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
216  1  1  A  216  HIS  A  216  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
217  1  1  A  217  ASP  A  217  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
218  1  1  A  218  GLY  A  218  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
219  1  1  A  219  TYR  A  219  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
220  1  1  A  220  SER  A  220  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
221  1  1  A  221  LEU  A  221  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
222  1  1  A  222  ASP  A  222  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
223  1  1  A  223  GLY  A  223  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
224  1  1  A  224  PRO  A  224  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
225  1  1  A  225  GLU  A  225  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
226  1  1  A  226  GLU  A  226  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
227  1  1  A  227  ILE  A  227  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
228  1  1  A  228  GLU  A  228  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
229  1  1  A  229  CYS  A  229  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
230  1  1  A  230  THR  A  230  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
231  1  1  A  231  LYS  A  231  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
232  1  1  A  232  LEU  A  232  .  ?        6     ?     ?     ?     ?  
233  1  1  A  233  GLY  A  233  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
234  1  1  A  234  ASN  A  234  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
235  1  1  A  235  TRP  A  235  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
236  1  1  A  236  SER  A  236  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
237  1  1  A  237  ALA  A  237  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
238  1  1  A  238  MET  A  238  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
239  1  1  A  239  PRO  A  239  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
240  1  1  A  240  SER  A  240  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
241  1  1  A  241  CYS  A  241  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
242  1  1  A  242  LYS  A  242  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
243  1  1  A  243  ALA  A  243  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
244  1  1  A  244  SER  A  244  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
245  1  1  A  245  CYS  A  245  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
246  1  1  A  246  LYS  A  246  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
247  1  1  A  247  VAL  A  247  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
248  1  1  A  248  PRO  A  248  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
249  1  1  A  249  VAL  A  249  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
250  1  1  A  250  LYS  A  250  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
251  1  1  A  251  LYS  A  251  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
252  1  1  A  252  ALA  A  252  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
253  1  1  A  253  THR  A  253  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
254  1  1  A  254  VAL  A  254  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
255  1  1  A  255  VAL  A  255  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
256  1  1  A  256  TYR  A  256  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
257  1  1  A  257  GLN  A  257  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
258  1  1  A  258  GLY  A  258  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
259  1  1  A  259  GLU  A  259  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
260  1  1  A  260  ARG  A  260  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
261  1  1  A  261  VAL  A  261  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
262  1  1  A  262  LYS  A  262  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
263  1  1  A  263  ILE  A  263  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
264  1  1  A  264  GLN  A  264  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
265  1  1  A  265  GLU  A  265  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
266  1  1  A  266  LYS  A  266  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
267  1  1  A  267  PHE  A  267  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
268  1  1  A  268  LYS  A  268  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
269  1  1  A  269  ASN  A  269  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
270  1  1  A  270  GLY  A  270  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
271  1  1  A  271  MET  A  271  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
272  1  1  A  272  LEU  A  272  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
273  1  1  A  273  HIS  A  273  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
274  1  1  A  274  GLY  A  274  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
275  1  1  A  275  ASP  A  275  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
276  1  1  A  276  LYS  A  276  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
277  1  1  A  277  VAL  A  277  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
278  1  1  A  278  SER  A  278  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
279  1  1  A  279  PHE  A  279  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
280  1  1  A  280  PHE  A  280  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
281  1  1  A  281  CYS  A  281  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
282  1  1  A  282  LYS  A  282  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
283  1  1  A  283  ASN  A  283  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
284  1  1  A  284  LYS  A  284  .  ?        2     ?     ?     ?     ?  
285  1  1  A  285  GLU  A  285  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
286  1  1  A  286  LYS  A  286  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
287  1  1  A  287  LYS  A  287  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
288  1  1  A  288  CYS  A  288  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
289  1  1  A  289  SER  A  289  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
290  1  1  A  290  TYR  A  290  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
291  1  1  A  291  THR  A  291  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
292  1  1  A  292  GLU  A  292  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
293  1  1  A  293  ASP  A  293  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
294  1  1  A  294  ALA  A  294  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
295  1  1  A  295  GLN  A  295  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
296  1  1  A  296  CYS  A  296  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
297  1  1  A  297  ILE  A  297  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
298  1  1  A  298  ASP  A  298  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
299  1  1  A  299  GLY  A  299  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
300  1  1  A  300  THR  A  300  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
301  1  1  A  301  ILE  A  301  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
302  1  1  A  302  GLU  A  302  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
303  1  1  A  303  VAL  A  303  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
304  1  1  A  304  PRO  A  304  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
305  1  1  A  305  LYS  A  305  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
306  1  1  A  306  CYS  A  306  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
307  1  1  A  307  PHE  A  307  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
308  1  1  A  308  LYS  A  308  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
309  1  1  A  309  GLU  A  309  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
310  1  1  A  310  HIS  A  310  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
311  1  1  A  311  SER  A  311  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
312  1  1  A  317  LYS  A  317  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
313  1  1  A  318  THR  A  318  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
314  1  1  A  319  ASP  A  319  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
315  1  1  A  320  ALA  A  320  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
316  1  1  A  321  SER  A  321  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
317  1  1  A  322  ASP  A  322  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
318  1  1  A  323  VAL  A  323  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
319  1  1  A  324  LYS  A  324  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
320  1  1  A  325  PRO  A  325  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
321  1  1  A  326  CYS  A  326  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
322  1  2  B    .  NAG  B    1  .  ?        ?     1     3     3     ?  
323  1  2  B    .  NAG  B    2  .  ?        ?     ?     ?     2     ?  
324  1  2  B    .  MAN  B    3  .  ?        ?     5     2     2     1  
325  1  2  B    .  FUC  B    4  .  ?        ?     2     1     ?     ?  
326  1  3  C    .  NAG  C    1  .  ?        ?     ?     ?     2     ?  
327  1  3  C    .  NAG  C    2  .  ?        ?     ?     1     4     ?  
328  1  3  C    .  FUC  C    3  .  ?        ?     ?     3     ?     ?  
329  1  4  D    .  NAG  A  401  .  ?        ?     2     1     2     ?  
330  1  4  E    .  NAG  A  402  .  ?        ?     1     ?     4     ?  
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.ordinal
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_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.rotamer_class
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.phi
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_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.ramachandran_class
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_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.angles_RMSZ
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.program_for_bond_angle_geometry
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.average_occupancy
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 91   91  m        -114.8   153.3  Favored  ?      4   71.620   6  0.65   8  0.59  molprobity  1.000  
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150  150  p        -140.4   155.3  Favored  ?      7   80.780   7  0.33  10  0.67  molprobity  1.000  
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155  155  t         -85.4   138.0  Favored  ?      4  127.250   6  1.03   8  1.12  molprobity  1.000  
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87  312  HB3   44  0.40  1.71  
88  313  H     44  0.40  1.71  
#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_mogul_bond_outliers.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_mogul_bond_outliers.instance_id
_pdbx_vrpt_instance_mogul_bond_outliers.atom_1
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_bond_outliers.stdev
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_bond_outliers.mindiff
 1  322  O5  C1  1.34  1.43  1714  0.02  -6.08  0.01  
 2  324  C1  C2  1.61  1.52   387  0.02   4.17  0.04  
 3  324  O5  C1  1.48  1.43  1714  0.02   2.80  0.00  
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10  329  O5  C1  1.52  1.43  1714  0.02   5.33  0.00  
11  330  C1  C2  1.56  1.52    34  0.01   2.67  0.01  
#
loop_
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_angle_outliers.instance_id
_pdbx_vrpt_instance_mogul_angle_outliers.atom_1
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_angle_outliers.stdev
_pdbx_vrpt_instance_mogul_angle_outliers.Zscore
_pdbx_vrpt_instance_mogul_angle_outliers.mindiff
 1  322  C3  C4  C5  115.90  110.24   1425  1.78   3.17  0.17  
 2  322  O4  C4  C3  105.37  110.35  10000  2.31  -2.15  0.00  
 3  322  C1  O5  C5  115.59  112.19     88  1.35   2.51  0.64  
 4  324  O3  C3  C2  114.08  109.99    666  1.91   2.13  0.01  
 5  324  C1  O5  C5  117.25  112.19     88  1.35   3.73  2.30  
 6  325  C1  O5  C5  118.96  112.78     31  2.27   2.73  1.87  
 7  327  C1  O5  C5  115.86  112.19     88  1.35   2.71  0.91  
 8  328  O5  C1  C2  114.70  110.77    275  1.54   2.54  0.14  
 9  328  O2  C2  C1  113.40  109.15    387  2.05   2.08  0.01  
10  328  C1  O5  C5  118.47  112.78     31  2.27   2.51  1.38  
11  329  C1  O5  C5  118.96  112.19     88  1.35   5.00  4.01  
#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.instance_id
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.atom_1
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.atom_2
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.atom_3
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.obsval
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.mean
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.numobs
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.stdev
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.mindiff
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.local_density
 1  322  C3  C2  N2  C7    58.80  64.52    67  26.77  3.08  2.99  
 2  322  C4  C5  C6  O6     5.22  80.08  6564  49.81  2.85  0.08  
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 8  326  C4  C5  C6  O6    35.90  49.48  6564  49.73  0.29  2.67  
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16  330  C1  C2  N2  C7   165.64  55.93   746  26.82  1.33  2.01  
17  330  C3  C2  N2  C7   -71.55  52.35    67  25.68  1.58  4.48  
18  330  C4  C5  C6  O6   120.54  60.26  6564   9.63  0.69  0.23  
19  330  O5  C5  C6  O6     0.50  66.08  6600  15.67  5.84  0.06  
#
_pdbx_vrpt_instance_mogul_ring_outliers.ordinal      1
_pdbx_vrpt_instance_mogul_ring_outliers.instance_id  324
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_ring_outliers.stdev        1.80
_pdbx_vrpt_instance_mogul_ring_outliers.mindiff      64.31
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance_density.ordinal
_pdbx_vrpt_model_instance_density.instance_id
_pdbx_vrpt_model_instance_density.natoms_eds
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_pdbx_vrpt_model_instance_density.RSR
_pdbx_vrpt_model_instance_density.RSRZ
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6  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  Y  
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