data_1JA2

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
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_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2001-05-29
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_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2023-08-16
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_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   N
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_pdbx_vrpt_entity.id           1
_pdbx_vrpt_entity.type         polymer
_pdbx_vrpt_entity.description  LYSOZYME
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_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id  A
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loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all   x-ray  
2  2.87  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore           
2  Ramachandran_outlier_percent  
3  rotamer_outliers_percent      
#
loop_
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_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
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_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1   0.40  141614     ?     ?  
2  2  1   0.61    2947  2.86  2.90  
3  1  2  19.33  138981     ?     ?  
4  2  2  48.36    2868  2.86  2.90  
5  1  3  56.63  138945     ?     ?  
6  2  3  82.24    2871  2.86  2.90  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
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_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A  19.33  
2  4  2  A  1  1  A  48.36  
3  5  3  A  1  1  A  56.63  
4  6  3  A  1  1  A  82.24  
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_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal          1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num    1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id        1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id    A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id     A
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#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                        1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers  0.79
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_rotamer_outliers       1.90
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore                     71.43
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                   959
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                 1021
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ                     0.52
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_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                    0.86
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
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_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
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_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
_pdbx_vrpt_model_instance.count_plane_outliers
  1  1  1  A    1  LYS  A    1  .  ?        ?     3     ?  
  2  1  1  A    2  VAL  A    2  .  ?        ?     ?     ?  
  3  1  1  A    3  PHE  A    3  .  ?        ?     6     ?  
  4  1  1  A    4  GLY  A    4  .  ?        ?     2     ?  
  5  1  1  A    5  ARG  A    5  .  ?        ?     ?     1  
  6  1  1  A    6  CYS  A    6  .  ?        ?     ?     ?  
  7  1  1  A    7  GLU  A    7  .  ?        ?     5     ?  
  8  1  1  A    8  LEU  A    8  .  ?        ?     2     ?  
  9  1  1  A    9  ALA  A    9  .  ?        ?     ?     ?  
 10  1  1  A   10  ALA  A   10  .  ?        ?     ?     ?  
 11  1  1  A   11  ALA  A   11  .  ?        ?     ?     ?  
 12  1  1  A   12  MET  A   12  .  ?        ?     ?     ?  
 13  1  1  A   13  LYS  A   13  .  ?        ?     ?     ?  
 14  1  1  A   14  ARG  A   14  .  ?        ?     6     ?  
 15  1  1  A   15  HIS  A   15  .  ?        ?     ?     ?  
 16  1  1  A   16  GLY  A   16  .  ?        1     ?     ?  
 17  1  1  A   17  LEU  A   17  .  ?        ?     3     ?  
 18  1  1  A   18  ASP  A   18  .  ?        ?     ?     ?  
 19  1  1  A   19  ASN  A   19  .  ?        ?     6     ?  
 20  1  1  A   20  TYR  A   20  .  ?        ?     7     ?  
 21  1  1  A   21  ARG  A   21  .  ?        ?     ?     1  
 22  1  1  A   22  GLY  A   22  .  ?        ?     ?     ?  
 23  1  1  A   23  TYR  A   23  .  ?        ?     1     ?  
 24  1  1  A   24  SER  A   24  .  ?        ?     6     ?  
 25  1  1  A   25  LEU  A   25  .  ?        ?     ?     ?  
 26  1  1  A   26  GLY  A   26  .  ?        ?     1     ?  
 27  1  1  A   27  ASN  A   27  .  ?        ?     ?     ?  
 28  1  1  A   28  TRP  A   28  .  ?        ?     ?     ?  
 29  1  1  A   29  VAL  A   29  .  ?        ?     2     ?  
 30  1  1  A   30  CYS  A   30  .  ?        ?     1     ?  
 31  1  1  A   31  ALA  A   31  .  ?        ?     ?     ?  
 32  1  1  A   32  ALA  A   32  .  ?        ?     ?     ?  
 33  1  1  A   33  LYS  A   33  .  ?        ?     5     ?  
 34  1  1  A   34  PHE  A   34  .  ?        ?     1     ?  
 35  1  1  A   35  GLU  A   35  .  ?        ?     1     ?  
 36  1  1  A   36  SER  A   36  .  ?        ?     6     ?  
 37  1  1  A   37  ASN  A   37  .  ?        ?     ?     ?  
 38  1  1  A   38  PHE  A   38  .  ?        ?     5     ?  
 39  1  1  A   39  ASN  A   39  .  ?        ?     2     ?  
 40  1  1  A   40  THR  A   40  .  ?        ?     1     ?  
 41  1  1  A   41  GLN  A   41  .  ?        ?     ?     ?  
 42  1  1  A   42  ALA  A   42  .  ?        ?     ?     ?  
 43  1  1  A   43  THR  A   43  .  ?        ?     ?     ?  
 44  1  1  A   44  ASN  A   44  .  ?        ?     1     ?  
 45  1  1  A   45  ARG  A   45  .  ?        ?     1     1  
 46  1  1  A   46  ASN  A   46  .  ?        ?     2     ?  
 47  1  1  A   47  THR  A   47  .  ?        ?     1     ?  
 48  1  1  A   48  ASP  A   48  .  ?        ?     1     ?  
 49  1  1  A   49  GLY  A   49  .  ?        ?     1     ?  
 50  1  1  A   50  SER  A   50  .  ?        ?     2     ?  
 51  1  1  A   51  THR  A   51  .  ?        ?     7     ?  
 52  1  1  A   52  ASP  A   52  .  ?        ?     6     ?  
 53  1  1  A   53  TYR  A   53  .  ?        ?     2     ?  
 54  1  1  A   54  GLY  A   54  .  ?        ?     3     ?  
 55  1  1  A   55  ILE  A   55  .  ?        ?     4     ?  
 56  1  1  A   56  LEU  A   56  .  ?        ?     ?     ?  
 57  1  1  A   57  GLN  A   57  .  ?        ?     3     ?  
 58  1  1  A   58  ILE  A   58  .  ?        ?     1     ?  
 59  1  1  A   59  ASN  A   59  .  ?        ?     1     ?  
 60  1  1  A   60  SER  A   60  .  ?        ?     4     ?  
 61  1  1  A   61  ARG  A   61  .  ?        ?    10     1  
 62  1  1  A   62  TRP  A   62  .  ?        ?     2     ?  
 63  1  1  A   63  TRP  A   63  .  ?        ?     1     ?  
 64  1  1  A   64  CYS  A   64  .  ?        ?     1     ?  
 65  1  1  A   65  ASN  A   65  .  ?        ?     2     ?  
 66  1  1  A   66  ASP  A   66  .  ?        ?     3     ?  
 67  1  1  A   67  GLY  A   67  .  ?        ?     ?     ?  
 68  1  1  A   68  ARG  A   68  .  ?        ?     1     1  
 69  1  1  A   69  THR  A   69  .  ?        ?     ?     ?  
 70  1  1  A   70  PRO  A   70  .  ?        ?     1     ?  
 71  1  1  A   71  GLY  A   71  .  ?        ?     ?     ?  
 72  1  1  A   72  SER  A   72  .  ?        ?     ?     ?  
 73  1  1  A   73  ARG  A   73  .  ?        ?     8     ?  
 74  1  1  A   74  ASN  A   74  .  ?        ?     ?     ?  
 75  1  1  A   75  LEU  A   75  .  ?        ?     7     ?  
 76  1  1  A   76  CYS  A   76  .  ?        ?     1     ?  
 77  1  1  A   77  ASN  A   77  .  ?        ?     2     ?  
 78  1  1  A   78  ILE  A   78  .  ?        ?     2     ?  
 79  1  1  A   79  PRO  A   79  .  ?        ?     6     ?  
 80  1  1  A   80  CYS  A   80  .  ?        ?     2     ?  
 81  1  1  A   81  SER  A   81  .  ?        ?     ?     ?  
 82  1  1  A   82  ALA  A   82  .  ?        ?     5     ?  
 83  1  1  A   83  LEU  A   83  .  ?        ?     ?     ?  
 84  1  1  A   84  LEU  A   84  .  ?        ?     5     ?  
 85  1  1  A   85  SER  A   85  .  ?        ?     ?     ?  
 86  1  1  A   86  SER  A   86  .  ?        ?     ?     ?  
 87  1  1  A   87  ASP  A   87  .  ?        ?     1     ?  
 88  1  1  A   88  ILE  A   88  .  ?        ?     ?     ?  
 89  1  1  A   89  THR  A   89  .  ?        ?     1     ?  
 90  1  1  A   90  ALA  A   90  .  ?        ?     ?     ?  
 91  1  1  A   91  SER  A   91  .  ?        ?     ?     ?  
 92  1  1  A   92  VAL  A   92  .  ?        ?    10     ?  
 93  1  1  A   93  ASN  A   93  .  ?        ?     ?     ?  
 94  1  1  A   94  CYS  A   94  .  ?        ?     3     ?  
 95  1  1  A   95  ALA  A   95  .  ?        ?     5     ?  
 96  1  1  A   96  LYS  A   96  .  ?        ?     4     ?  
 97  1  1  A   97  LYS  A   97  .  ?        ?    14     ?  
 98  1  1  A   98  ILE  A   98  .  ?        ?     5     ?  
 99  1  1  A   99  VAL  A   99  .  ?        ?     2     ?  
100  1  1  A  100  SER  A  100  .  ?        ?     1     ?  
101  1  1  A  101  ASP  A  101  .  ?        ?     ?     ?  
102  1  1  A  102  GLY  A  102  .  ?        ?     ?     ?  
103  1  1  A  103  ASN  A  103  .  ?        ?     ?     ?  
104  1  1  A  104  GLY  A  104  .  ?        ?     ?     ?  
105  1  1  A  105  MET  A  105  .  ?        ?     1     ?  
106  1  1  A  106  ASN  A  106  .  ?        ?     ?     ?  
107  1  1  A  107  ALA  A  107  .  ?        ?     1     ?  
108  1  1  A  108  TRP  A  108  .  ?        ?     ?     ?  
109  1  1  A  109  VAL  A  109  .  ?        ?     2     ?  
110  1  1  A  110  ALA  A  110  .  ?        ?     5     ?  
111  1  1  A  111  TRP  A  111  .  ?        ?    16     ?  
112  1  1  A  112  ARG  A  112  .  ?        ?     2     1  
113  1  1  A  113  ASN  A  113  .  ?        ?     ?     ?  
114  1  1  A  114  ARG  A  114  .  ?        ?     5     1  
115  1  1  A  115  CYS  A  115  .  ?        ?    10     ?  
116  1  1  A  116  LYS  A  116  .  ?        ?     9     ?  
117  1  1  A  117  GLY  A  117  .  ?        ?     ?     ?  
118  1  1  A  118  THR  A  118  .  ?        ?     3     ?  
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#
loop_
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182   92  O      93  0.41  2.66  
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1  molprobity   4.02b-467                                                             Y  
2  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  Y  
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