data_2IL1

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
_pdbx_vrpt_database.code  2IL1
#
_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   x-ray
#
_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    2IL1
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2006-10-02
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         5
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2023-08-30
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2023-08-20:14:14
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,xtriage,eds,mogul,buster-report,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   Y
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer      Rab12  
2  non-polymer  "MAGNESIUM ION"  
3  non-polymer  "CALCIUM ION"  
4  non-polymer  "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE"  
5  non-polymer  "UNKNOWN ATOM OR ION"  
6  water        water  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  2  
C  3  
D  4  
E  5  
F  5  
G  5  
H  5  
I  5  
J  5  
K  6  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all  x-ray  
2  2.1  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore           
2  Ramachandran_outlier_percent  
3  rotamer_outliers_percent      
4  RSRZ_outliers_percent         
5  R_value_R_free                
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
 1  1  1   75.45  141614     ?     ?  
 2  2  1   77.11    5710  2.10  2.10  
 3  1  2  100.00  138981     ?     ?  
 4  2  2  100.00    5647  2.10  2.10  
 5  1  3   64.57  138945     ?     ?  
 6  2  3   70.75    5648  2.10  2.10  
 7  1  4   89.03  127900     ?     ?  
 8  2  4   90.79    5083  2.10  2.10  
 9  1  5    5.15  130704     ?     ?  
10  2  5    2.31    5197  2.10  2.10  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A  100.00  
2  4  2  A  1  1  A  100.00  
3  5  3  A  1  1  A   64.57  
4  6  3  A  1  1  A   70.75  
5  7  4  A  1  1  A   89.03  
6  8  4  A  1  1  A   90.79  
#
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal          1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num    1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id        1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id    A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id     A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ      0.67
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ       0.74
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ   1317
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ  1767
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                        1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers  0.00
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_rotamer_outliers       1.53
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore                     3.05
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                   1293
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                 1317
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ                     0.74
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ                1767
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                    0.67
#
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.exp_method                x-ray
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.ordinal                   1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Babinet_b                 85.675
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.bulk_solvent_b            58.174
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_estimate         43.147
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.I_over_sigma              1.50(2.00A)
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.num_miller_indices        13445
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Babinet_k                 0.237
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.bulk_solvent_k            0.338
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L_mean     0.490
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L2_mean    0.324
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Fo_Fc_correlation         0.931
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_R                     0.27
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_Rfree                 0.30
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_R                     0.27
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_res_high              2.00
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_res_low               39.37
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_aniso            "[43.613,43.613,42.113,-0.000,0.000,0.000]"
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_anisotropy           0.035
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.trans_NCS_details         "The largest off-origin peak in the Patterson function is 7.40% of the height of the origin peak. No significant pseudotranslation is detected."
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.B_factor_type             FULL
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.acentric_outliers         1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.centric_outliers          2
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_completeness         94.44
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.number_reflns_R_free      671
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.percent_free_reflections  4.99
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.percent_RSRZ_outliers     0.61
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_high       2.10
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_low        30.00
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_R                     0.24
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_Rfree                 0.27
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_torsion_outliers
  1  1  1  A   22  PRO  A   134  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  2  1  1  A   23  ALA  A   135  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  3  1  1  A   24  ASP  A   136  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  4  1  1  A   25  PHE  A   137  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  5  1  1  A   26  LYS  A   138  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  6  1  1  A   27  LEU  A   139  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  7  1  1  A   28  GLN  A   140  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  8  1  1  A   29  VAL  A   141  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  9  1  1  A   30  ILE  A   142  A  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 10  1  1  A   30  ILE  A   142  B  ?        ?     2     ?     ?     ?  
 11  1  1  A   31  ILE  A   143  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 12  1  1  A   32  ILE  A   144  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 13  1  1  A   33  GLY  A   145  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 14  1  1  A   34  SER  A   146  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 15  1  1  A   35  ARG  A   147  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 16  1  1  A   36  GLY  A   148  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 17  1  1  A   37  VAL  A   149  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 18  1  1  A   38  GLY  A   150  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 19  1  1  A   39  LYS  A   151  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 20  1  1  A   40  THR  A   152  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 21  1  1  A   41  SER  A   153  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 22  1  1  A   42  LEU  A   154  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 23  1  1  A   43  MET  A   155  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 24  1  1  A   44  GLU  A   156  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 25  1  1  A   45  ARG  A   157  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 26  1  1  A   46  PHE  A   158  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 27  1  1  A   47  THR  A   159  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 28  1  1  A   48  ASP  A   160  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 29  1  1  A   57  SER  A   169  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 30  1  1  A   58  THR  A   170  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 31  1  1  A   59  VAL  A   171  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 32  1  1  A   60  GLY  A   172  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 33  1  1  A   61  VAL  A   173  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 34  1  1  A   62  ASP  A   174  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 35  1  1  A   63  PHE  A   175  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 36  1  1  A   64  LYS  A   176  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 37  1  1  A   65  ILE  A   177  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 38  1  1  A   66  LYS  A   178  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 39  1  1  A   67  THR  A   179  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 40  1  1  A   68  VAL  A   180  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 41  1  1  A   69  GLU  A   181  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 42  1  1  A   70  LEU  A   182  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 43  1  1  A   71  ARG  A   183  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 44  1  1  A   72  GLY  A   184  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 45  1  1  A   73  LYS  A   185  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 46  1  1  A   74  LYS  A   186  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 47  1  1  A   75  ILE  A   187  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 48  1  1  A   76  ARG  A   188  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 49  1  1  A   77  LEU  A   189  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 50  1  1  A   78  GLN  A   190  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 51  1  1  A   79  ILE  A   191  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 52  1  1  A   80  TRP  A   192  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 53  1  1  A   81  ASP  A   193  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 54  1  1  A   82  THR  A   194  .  ?        ?     2     ?     ?     ?  
 55  1  1  A   83  ALA  A   195  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 56  1  1  A   84  GLY  A   196  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 57  1  1  A   85  GLN  A   197  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 58  1  1  A   86  GLU  A   198  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 59  1  1  A   87  ARG  A   199  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 60  1  1  A   88  PHE  A   200  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 61  1  1  A   89  ASN  A   201  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 62  1  1  A   90  SER  A   202  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 63  1  1  A   91  ILE  A   203  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 64  1  1  A   92  THR  A   204  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 65  1  1  A   93  SER  A   205  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 66  1  1  A   94  ALA  A   206  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 67  1  1  A   95  TYR  A   207  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 68  1  1  A   96  TYR  A   208  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 69  1  1  A   97  ARG  A   209  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 70  1  1  A   98  SER  A   210  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 71  1  1  A   99  ALA  A   211  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 72  1  1  A  100  LYS  A   212  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 73  1  1  A  101  GLY  A   213  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 74  1  1  A  102  ILE  A   214  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 75  1  1  A  103  ILE  A   215  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 76  1  1  A  104  LEU  A   216  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 77  1  1  A  105  VAL  A   217  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 78  1  1  A  106  TYR  A   218  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 79  1  1  A  107  ASP  A   219  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 80  1  1  A  108  ILE  A   220  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 81  1  1  A  109  THR  A   221  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 82  1  1  A  110  LYS  A   222  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 83  1  1  A  111  LYS  A   223  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 84  1  1  A  112  GLU  A   224  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 85  1  1  A  113  THR  A   225  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 86  1  1  A  114  PHE  A   226  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 87  1  1  A  115  ASP  A   227  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 88  1  1  A  116  ASP  A   228  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 89  1  1  A  117  LEU  A   229  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 90  1  1  A  118  PRO  A   230  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 91  1  1  A  119  LYS  A   231  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 92  1  1  A  120  TRP  A   232  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 93  1  1  A  121  MET  A   233  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 94  1  1  A  122  LYS  A   234  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 95  1  1  A  123  MET  A   235  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 96  1  1  A  124  ILE  A   236  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 97  1  1  A  125  ASP  A   237  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 98  1  1  A  126  LYS  A   238  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 99  1  1  A  127  TYR  A   239  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
100  1  1  A  128  ALA  A   240  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
101  1  1  A  129  SER  A   241  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
102  1  1  A  130  GLU  A   242  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
103  1  1  A  131  ASP  A   243  A  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
104  1  1  A  131  ASP  A   243  B  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
105  1  1  A  132  ALA  A   244  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
106  1  1  A  133  GLU  A   245  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
107  1  1  A  134  LEU  A   246  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
108  1  1  A  135  LEU  A   247  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
109  1  1  A  136  LEU  A   248  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
110  1  1  A  137  VAL  A   249  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
111  1  1  A  138  GLY  A   250  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
112  1  1  A  139  ASN  A   251  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
113  1  1  A  140  LYS  A   252  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
114  1  1  A  141  LEU  A   253  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
115  1  1  A  142  ASP  A   254  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
116  1  1  A  143  CYS  A   255  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
117  1  1  A  144  GLU  A   256  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
118  1  1  A  145  THR  A   257  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
119  1  1  A  146  ASP  A   258  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
120  1  1  A  147  ARG  A   259  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
121  1  1  A  148  GLU  A   260  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
122  1  1  A  149  ILE  A   261  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
123  1  1  A  150  THR  A   262  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
124  1  1  A  151  ARG  A   263  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
125  1  1  A  152  GLN  A   264  A  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
126  1  1  A  152  GLN  A   264  B  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
127  1  1  A  153  GLN  A   265  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
128  1  1  A  154  GLY  A   266  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
129  1  1  A  155  GLU  A   267  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
130  1  1  A  156  LYS  A   268  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
131  1  1  A  157  PHE  A   269  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
132  1  1  A  158  ALA  A   270  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
133  1  1  A  159  GLN  A   271  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
134  1  1  A  160  GLN  A   272  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
135  1  1  A  161  ILE  A   273  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
136  1  1  A  162  THR  A   274  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
137  1  1  A  163  GLY  A   275  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
138  1  1  A  164  MET  A   276  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
139  1  1  A  165  ARG  A   277  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
140  1  1  A  166  PHE  A   278  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
141  1  1  A  167  CYS  A   279  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
142  1  1  A  168  GLU  A   280  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
143  1  1  A  169  ALA  A   281  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
144  1  1  A  170  SER  A   282  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
145  1  1  A  171  ALA  A   283  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
146  1  1  A  172  LYS  A   284  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
147  1  1  A  173  ASP  A   285  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
148  1  1  A  174  ASN  A   286  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
149  1  1  A  175  PHE  A   287  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
150  1  1  A  176  ASN  A   288  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
151  1  1  A  177  VAL  A   289  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
152  1  1  A  178  ASP  A   290  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
153  1  1  A  179  GLU  A   291  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
154  1  1  A  180  ILE  A   292  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
155  1  1  A  181  PHE  A   293  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
156  1  1  A  182  LEU  A   294  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
157  1  1  A  183  LYS  A   295  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
158  1  1  A  184  LEU  A   296  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
159  1  1  A  185  VAL  A   297  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
160  1  1  A  186  ASP  A   298  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
161  1  1  A  187  ASP  A   299  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
162  1  1  A  188  ILE  A   300  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
163  1  1  A  189  LEU  A   301  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
164  1  1  A  190  LYS  A   302  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
165  1  1  A  191  LYS  A   303  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
166  1  1  A  192  MET  A   304  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
167  1  2  B    .  MG   A   402  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
168  1  3  C    .  CA   A   501  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
169  1  4  D    .  GDP  A   401  .  ?        ?     ?     3     4     2  
170  1  5  E    .  UNX  A  1401  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
171  1  5  F    .  UNX  A  1402  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
172  1  5  G    .  UNX  A  1403  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
173  1  5  H    .  UNX  A  1404  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
174  1  5  I    .  UNX  A  1405  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
175  1  5  J    .  UNX  A  1406  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
176  1  6  K    .  HOH  A  1001  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
177  1  6  K    .  HOH  A  1002  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
178  1  6  K    .  HOH  A  1003  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
179  1  6  K    .  HOH  A  1004  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
180  1  6  K    .  HOH  A  1006  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
181  1  6  K    .  HOH  A  1007  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
182  1  6  K    .  HOH  A  1008  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
183  1  6  K    .  HOH  A  1009  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
184  1  6  K    .  HOH  A  1010  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
185  1  6  K    .  HOH  A  1011  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
186  1  6  K    .  HOH  A  1012  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
187  1  6  K    .  HOH  A  1013  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
188  1  6  K    .  HOH  A  1014  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
189  1  6  K    .  HOH  A  1015  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
190  1  6  K    .  HOH  A  1016  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
191  1  6  K    .  HOH  A  1017  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
192  1  6  K    .  HOH  A  1018  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
193  1  6  K    .  HOH  A  1019  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
194  1  6  K    .  HOH  A  1020  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
195  1  6  K    .  HOH  A  1021  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
196  1  6  K    .  HOH  A  1022  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
197  1  6  K    .  HOH  A  1023  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
198  1  6  K    .  HOH  A  1024  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
199  1  6  K    .  HOH  A  1025  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
#
loop_
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_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.average_occupancy
  1    1  Cg_exo        ?       ?  ?           7  51.740     8  0.35    11  0.22  molprobity  1.000  
  2    2  ?         -75.6   147.4  Favored     5  48.190     5  0.20     7  0.33  molprobity  1.000  
  3    3  m-20      -79.7   -34.5  Favored     4  43.830     8  0.32    11  0.52  molprobity  1.000  
  4    4  m-85     -138.2   147.1  Favored     9  43.380    12  0.79    16  0.44  molprobity  1.000  
  5    5  ?        -111.3   129.8  Favored     8  37.390     8  0.70    10  0.48  molprobity  1.000  
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 11   11  mt       -113.5   121.9  Favored    11  38.380     8  0.44    11  0.83  molprobity  1.000  
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 13   13  ?         136.8   165.4  Favored     3  35.880     4  0.72     5  0.53  molprobity  1.000  
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 15   15  OUTLIER   -65.4   141.1  Favored    13  46.420    11  0.79    14  1.98  molprobity  1.000  
 16   16  ?          88.6     5.2  Favored     3  36.810     4  0.82     5  0.28  molprobity  1.000  
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 18   18  ?         110.1    24.4  Favored     3  34.930     4  1.11     5  0.39  molprobity  1.000  
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 51   51  mt       -109.4   114.8  Favored    11  39.500     8  0.75    11  0.60  molprobity  1.000  
 52   52  m95       -91.0   130.8  Favored    10  40.720    16  0.83    23  0.49  molprobity  1.000  
 53   53  t0       -110.7   116.6  Favored     4  41.700     8  0.62    11  0.79  molprobity  1.000  
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 56   56  ?         -96.7   -26.6  Favored     3  39.560     4  0.35     5  0.55  molprobity  1.000  
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 61   61  m-20      -60.3   -44.5  Favored     6  42.280     8  0.65    11  0.34  molprobity  1.000  
 62   62  t         -54.0   -54.0  Favored     5  45.190     6  0.45     8  0.74  molprobity  1.000  
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 65   65  p         -52.2   -37.1  Favored     5  35.110     6  0.67     8  0.64  molprobity  1.000  
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 69   69  ?         -64.4   -38.4  Favored     6  43.700     7  0.44     9  0.51  molprobity  1.000  
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 71   71  ?         -67.0   129.2  Favored     5  39.360     5  0.72     7  0.53  molprobity  1.000  
 72   72  mttt      -88.5   -21.4  Favored    13  43.130     9  0.89    11  0.50  molprobity  1.000  
 73   73  ?        -142.5   151.4  Favored     3  33.330     4  0.73     5  0.94  molprobity  1.000  
 74   74  mt       -134.2   128.0  Favored    11  33.860     8  1.21    11  0.88  molprobity  1.000  
 75   75  mt       -107.4   116.6  Favored    11  36.760     8  0.65    11  0.72  molprobity  1.000  
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 77   77  t        -113.8   138.1  Favored     9  35.140     7  0.92    10  0.55  molprobity  1.000  
 78   78  p90      -127.9   172.1  Favored     9  34.610    13  1.19    18  0.75  molprobity  1.000  
 79   79  t0       -107.7   114.5  Favored     4  37.940     8  0.52    11  1.55  molprobity  1.000  
 80   80  pt        -57.1   -21.9  Favored    11  35.760     8  0.68    11  0.77  molprobity  1.000  
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 88   88  m-20      -77.5   -14.1  Favored     4  38.040     8  0.46    11  0.96  molprobity  1.000  
 89   89  mt        -53.9   -39.4  Favored    11  36.230     8  0.98    12  0.94  molprobity  1.000  
 90   90  Cg_exo    -59.2   -36.4  Favored     7  33.870     8  0.76    11  0.53  molprobity  1.000  
 91   91  ttpt      -60.6   -45.7  Favored    13  45.370     9  0.59    11  0.38  molprobity  1.000  
 92   92  m95       -61.3   -38.8  Favored    10  36.730    16  0.59    23  0.58  molprobity  1.000  
 93   93  mmm       -65.7   -33.2  Favored     9  36.890     8  0.73    10  0.71  molprobity  1.000  
 94   94  mttt      -67.6   -40.4  Favored    13  41.210     9  0.78    11  0.86  molprobity  1.000  
 95   95  mmm       -57.4   -47.0  Favored     9  38.990     8  0.60    10  0.47  molprobity  1.000  
 96   96  mt        -56.8   -47.4  Favored    11  35.640     8  0.81    11  0.52  molprobity  1.000  
 97   97  t70       -58.2   -41.4  Favored     4  36.130     8  0.65    11  0.76  molprobity  1.000  
 98   98  mtpt      -71.1   -39.5  Favored    13  46.110     9  0.27    11  0.61  molprobity  1.000  
 99   99  m-85     -122.6   -28.4  Favored     9  42.490    13  0.58    18  0.65  molprobity  1.000  
100  100  ?         -68.8   157.9  Favored     5  36.890     5  0.46     7  0.26  molprobity  1.000  
101  101  m         -66.0   146.8  Favored     5  39.520     6  0.34     8  0.47  molprobity  1.000  
102  102  ?         -56.8   -32.6  Favored     2  42.330     5  0.54     7  0.32  molprobity  1.000  
103  103  m-20      -96.5    12.1  Favored     4  43.480     8  0.37    11  0.52  molprobity  1.000  
104  104  m-20      -96.5    12.1  Favored     4  43.480     8  0.37    11  0.52  molprobity  1.000  
105  105  ?         -63.8   137.7  Favored     4  39.410     5  0.65     7  0.69  molprobity  1.000  
106  106  mm-40     -89.9   142.0  Favored     6  42.140     9  0.96    12  0.47  molprobity  1.000  
107  107  mt       -123.5   143.9  Favored    11  36.400     8  0.55    11  1.03  molprobity  1.000  
108  108  tt       -138.1   125.4  Favored    11  39.930     8  0.75    11  0.63  molprobity  1.000  
109  109  tp        -94.9   131.3  Favored    11  32.580     8  0.62    11  0.56  molprobity  1.000  
110  110  t        -124.3   120.6  Favored     9  37.970     7  0.73    10  0.98  molprobity  1.000  
111  111  ?         -88.7   102.2  Favored     3  35.030     4  1.27     5  0.45  molprobity  1.000  
112  112  t30       -89.2   166.3  Favored     6  37.550     8  0.83    11  0.64  molprobity  1.000  
113  113  mttt       75.2    34.7  Allowed    13  38.050     9  0.73    11  0.97  molprobity  1.000  
114  114  tp        -54.4   -28.3  Favored    11  39.900     8  0.46    11  0.47  molprobity  1.000  
115  115  p-10      -64.0   -22.3  Favored     4  41.830     8  0.78    11  0.46  molprobity  1.000  
116  116  m         -95.7    35.6  Allowed     5  45.710     6  0.63     8  0.70  molprobity  1.000  
117  117  tp10      -49.3   -31.3  Favored     6  54.770     9  0.38    12  0.73  molprobity  1.000  
118  118  p         -72.6   -24.3  Favored     7  50.810     7  0.64    10  0.81  molprobity  1.000  
119  119  m-20      -95.6    10.1  Favored     4  44.370     8  0.27    11  0.39  molprobity  1.000  
120  120  ttm-85    -53.4   122.7  Favored    13  43.930    11  0.60    14  0.59  molprobity  1.000  
121  121  mt-10    -103.5   -26.8  Favored     6  43.050     9  0.60    12  0.32  molprobity  1.000  
122  122  mm       -117.6   130.3  Favored    11  38.400     8  0.94    11  0.75  molprobity  1.000  
123  123  p         -78.9   165.2  Favored     7  38.120     7  0.64    10  0.63  molprobity  1.000  
124  124  ttt85     -67.5   -34.5  Favored    13  45.480    11  0.48    14  0.76  molprobity  1.000  
125  125  ?         -65.7   -38.8  Favored     4  39.190     6  0.25     8  0.42  molprobity  1.000  
126  126  ?         -65.7   -38.8  Favored     4  39.190     6  0.25     8  0.42  molprobity  1.000  
127  127  mt-30     -57.3   -49.5  Favored     8  37.210     9  0.41    12  0.36  molprobity  1.000  
128  128  ?         -62.9   -42.5  Favored     3  34.420     4  0.36     5  0.31  molprobity  1.000  
129  129  mt-10     -64.5   -44.7  Favored     6  39.050     9  0.52    12  0.45  molprobity  1.000  
130  130  ?         -65.0   -39.6  Favored     4  36.420     6  0.74     8  0.34  molprobity  1.000  
131  131  t80       -58.2   -51.0  Favored     9  35.110    12  0.73    16  0.48  molprobity  1.000  
132  132  ?         -62.5   -37.6  Favored     5  36.830     5  0.40     7  0.64  molprobity  1.000  
133  133  ?         -62.8   -32.1  Favored     6  38.260     7  0.66     9  0.66  molprobity  1.000  
134  134  mt-30     -67.0   -24.2  Favored     8  41.240     9  1.25    12  1.08  molprobity  1.000  
135  135  mm       -103.9   114.3  Favored    11  35.090     8  0.62    11  0.60  molprobity  1.000  
136  136  m         -62.3   120.1  Favored     7  37.400     7  0.79    10  0.66  molprobity  1.000  
137  137  ?          91.9    -9.8  Favored     3  38.310     4  0.35     5  0.86  molprobity  1.000  
138  138  ttm       -78.7   125.7  Favored     9  37.860     8  0.78    10  0.47  molprobity  1.000  
139  139  ttm-85    -83.4   161.2  Favored    13  48.700    11  0.69    14  0.34  molprobity  1.000  
140  140  t80      -139.9   142.9  Favored     9  35.490    12  0.70    16  0.46  molprobity  1.000  
141  141  p        -155.9   170.5  Favored     4  39.560     6  2.82     8  1.00  molprobity  1.000  
142  142  mt-10    -106.7   152.7  Favored     6  39.020     9  1.23    12  0.92  molprobity  1.000  
143  143  ?        -149.0   162.6  Favored     5  37.260     5  0.76     7  0.62  molprobity  1.000  
144  144  t        -133.6   108.8  Favored     5  37.240     6  0.45     8  0.37  molprobity  1.000  
145  145  ?         -58.6   -41.5  Favored     5  40.060     5  0.50     7  0.42  molprobity  1.000  
146  146  ?         -61.0   -49.1  Favored     6  37.910     7  0.65     9  0.65  molprobity  1.000  
147  147  m-20      -89.7     4.7  Favored     4  37.960     8  0.62    11  0.83  molprobity  1.000  
148  148  t30        54.2    45.3  Favored     6  38.910     8  0.74    11  0.48  molprobity  1.000  
149  149  t80      -107.6   121.7  Favored     9  36.920    12  1.19    16  0.52  molprobity  1.000  
150  150  m-20       65.0    14.1  Favored     6  36.330     8  0.62    11  0.56  molprobity  1.000  
151  151  t         -68.2   -51.3  Favored     9  39.260     7  0.74    10  0.73  molprobity  1.000  
152  152  m-20      -61.4   -40.1  Favored     4  39.450     8  0.54    11  0.85  molprobity  1.000  
153  153  mp0       -66.9   -35.1  Favored     6  37.380     9  1.29    12  0.90  molprobity  1.000  
154  154  pt        -65.4   -42.6  Favored    11  40.710     8  0.81    11  0.58  molprobity  1.000  
155  155  m-85      -71.6   -45.1  Favored     9  37.730    12  1.22    16  0.35  molprobity  1.000  
156  156  mt        -66.0   -39.9  Favored    11  40.500     8  0.76    11  0.61  molprobity  1.000  
157  157  tptt      -67.5   -44.8  Favored    13  43.030     9  0.83    11  0.44  molprobity  1.000  
158  158  tp        -57.2   -49.5  Favored    11  37.380     8  0.63    11  0.41  molprobity  1.000  
159  159  t         -55.1   -41.3  Favored     9  36.480     7  1.09    10  0.61  molprobity  1.000  
160  160  t0        -62.6   -49.4  Favored     4  38.600     8  0.72    11  0.55  molprobity  1.000  
161  161  m-20      -53.0   -43.3  Favored     4  45.870     8  0.31    11  0.54  molprobity  1.000  
162  162  mt        -63.2   -53.3  Favored    11  37.580     8  0.47    11  0.34  molprobity  1.000  
163  163  mt        -59.7   -34.1  Favored    11  40.280     8  0.44    11  0.49  molprobity  1.000  
164  164  mttm      -61.4   -38.8  Favored    13  52.120     9  0.21    11  0.44  molprobity  1.000  
165  165  ?         -89.4     0.9  Favored     4  62.690     6  0.39     8  0.48  molprobity  1.000  
166  166  ptp           ?       ?  ?           9  69.540     8  0.60     7  0.92  molprobity  1.000  
167  167  ?             ?       ?  ?           ?  35.700     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
168  168  ?             ?       ?  ?           ?  30.280     ?     ?     ?     ?  ?           0.500  
169  169  ?             ?       ?  ?          12  34.940    24  1.06    30  1.23  mogul       1.000  
170  170  ?             ?       ?  ?           ?   2.000     ?     ?     ?     ?  ?           0.010  
171  171  ?             ?       ?  ?           ?   2.000     ?     ?     ?     ?  ?           0.010  
172  172  ?             ?       ?  ?           ?   2.110     ?     ?     ?     ?  ?           0.010  
173  173  ?             ?       ?  ?           ?   2.240     ?     ?     ?     ?  ?           0.010  
174  174  ?             ?       ?  ?           ?   2.000     ?     ?     ?     ?  ?           0.010  
175  175  ?             ?       ?  ?           ?  16.380     ?     ?     ?     ?  ?           0.010  
176  176  ?             ?       ?  ?           ?  26.360     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
177  177  ?             ?       ?  ?           ?  33.620     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
178  178  ?             ?       ?  ?           ?  36.100     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
179  179  ?             ?       ?  ?           ?  30.040     ?     ?     ?     ?  ?           0.500  
180  180  ?             ?       ?  ?           ?  36.700     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
181  181  ?             ?       ?  ?           ?  41.440     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
182  182  ?             ?       ?  ?           ?  40.580     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
183  183  ?             ?       ?  ?           ?  33.940     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
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#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_clashes.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_clashes.instance_id
_pdbx_vrpt_instance_clashes.label_atom_id
_pdbx_vrpt_instance_clashes.cid
_pdbx_vrpt_instance_clashes.clashmag
_pdbx_vrpt_instance_clashes.dist
 1    9  HG22  1  0.51  1.92  
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 3   10  HD11  3  0.47  2.41  
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11  124  NE    7  0.49  2.36  
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13  148  HB2   4  0.40  2.51  
14  155  O     8  0.41  2.21  
15  159  HG23  8  0.41  2.21  
16  181  O     6  0.44  2.16  
#
_pdbx_vrpt_instance_intra_bond_outliers.ordinal      1
_pdbx_vrpt_instance_intra_bond_outliers.instance_id  141
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#
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1  169  PB     O2B    1.46  1.54  448  0.04  -2.18  0.00  
2  169  "O4'"  "C1'"  1.45  1.41   20  0.01   3.40  0.02  
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#
loop_
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_angle_outliers.Zscore
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1  169  O3B  PB  O2B  117.26  107.64  224  3.82   2.52  0.15  
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4  169  C5   C6  N1   118.42  113.95   45  1.77   2.53  1.58  
#
loop_
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.numobs
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.stdev
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.mindiff
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.local_density
1  169  PA  O3A  PB  O2B  139.03  56.74  47  29.06   9.70  2.13  
2  169  PA  O3A  PB  O3B   12.45  85.31  47  48.58  16.77  0.00  
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance_density.ordinal
_pdbx_vrpt_model_instance_density.instance_id
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6  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  Y  
##
