data_8CKG

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
_pdbx_vrpt_database.code  8CKG
#
_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   x-ray
#
_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    8CKG
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2023-02-15
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         1
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2024-02-28
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2024-02-22:18:09
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,xtriage,eds,mogul,buster-report,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   Y
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer      Semaphorin-5A  
2  non-polymer  "SULFATE ION"  
3  non-polymer  alpha-D-mannopyranose  
4  water        water  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  1  
C  2  
D  3  
E  3  
F  2  
G  3  
H  3  
I  4  
J  4  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all    x-ray  
2  1.714  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore           
2  Ramachandran_outlier_percent  
3  rotamer_outliers_percent      
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1   78.87  141614     ?     ?  
2  2  1   71.77    6152  1.70  1.74  
3  1  2  100.00  138981     ?     ?  
4  2  2  100.00    6051  1.70  1.74  
5  1  3  100.00  138945     ?     ?  
6  2  3  100.00    6051  1.70  1.74  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A  100.00  
2  4  2  A  1  1  A  100.00  
3  5  3  A  1  1  A  100.00  
4  6  3  A  1  1  A  100.00  
5  3  2  B  1  1  B  100.00  
6  4  2  B  1  1  B  100.00  
7  5  3  B  1  1  B  100.00  
8  6  3  B  1  1  B  100.00  
#
loop_
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ
1  1  1  A  A  0.63  0.39  786  1066  
2  1  1  B  B  0.62  0.38  903  1227  
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                        1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers  0.00
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_rotamer_outliers       0.00
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore                     2.77
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                   1550
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                 1689
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ                     0.38
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ                2293
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                    0.63
#
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.exp_method              x-ray
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.ordinal                 1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_estimate       30.580
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.I_over_sigma            1.19(1.71A)
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.num_miller_indices      20986
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L_mean   0.500
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L2_mean  0.334
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_R                   0.21
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_Rfree               0.23
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_aniso          "[29.990,31.030,31.216,0.000,-0.196,0.000]"
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_anisotropy         0.040
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.trans_NCS_details       "The largest off-origin peak in the Patterson function is 8.56% of the height of the origin peak. No significant pseudotranslation is detected."
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.B_factor_type           FULL
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.acentric_outliers       0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.centric_outliers        0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_high     1.71
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_low      51.67
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_R                   0.21
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_Rfree               0.23
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
_pdbx_vrpt_model_instance.ligand_of_interest
  1  1  1  A    6  MET  A  654  .  ?        ?  ?     
  2  1  1  A    7  PHE  A  655  .  ?        ?  ?     
  3  1  1  A    8  TRP  A  656  .  ?        ?  ?     
  4  1  1  A    9  THR  A  657  .  ?        ?  ?     
  5  1  1  A   10  GLY  A  658  .  ?        ?  ?     
  6  1  1  A   11  TRP  A  659  .  ?        1  ?     
  7  1  1  A   12  GLY  A  660  .  ?        ?  ?     
  8  1  1  A   13  PRO  A  661  .  ?        ?  ?     
  9  1  1  A   14  TRP  A  662  .  ?        2  ?     
 10  1  1  A   15  GLU  A  663  .  ?        ?  ?     
 11  1  1  A   16  ARG  A  664  .  ?        ?  ?     
 12  1  1  A   17  CYS  A  665  .  ?        ?  ?     
 13  1  1  A   18  THR  A  666  .  ?        ?  ?     
 14  1  1  A   19  ALA  A  667  .  ?        ?  ?     
 15  1  1  A   20  GLN  A  668  .  ?        ?  ?     
 16  1  1  A   21  CYS  A  669  .  ?        ?  ?     
 17  1  1  A   22  GLY  A  670  .  ?        ?  ?     
 18  1  1  A   23  GLY  A  671  .  ?        ?  ?     
 19  1  1  A   24  GLY  A  672  .  ?        ?  ?     
 20  1  1  A   25  ILE  A  673  .  ?        ?  ?     
 21  1  1  A   26  GLN  A  674  .  ?        ?  ?     
 22  1  1  A   27  ALA  A  675  .  ?        ?  ?     
 23  1  1  A   28  ARG  A  676  .  ?        3  ?     
 24  1  1  A   29  ARG  A  677  .  ?        ?  ?     
 25  1  1  A   30  ARG  A  678  .  ?        ?  ?     
 26  1  1  A   31  ILE  A  679  .  ?        ?  ?     
 27  1  1  A   32  CYS  A  680  .  ?        ?  ?     
 28  1  1  A   33  GLU  A  681  .  ?        ?  ?     
 29  1  1  A   34  ASN  A  682  .  ?        ?  ?     
 30  1  1  A   35  GLY  A  683  .  ?        ?  ?     
 31  1  1  A   36  PRO  A  684  .  ?        ?  ?     
 32  1  1  A   37  ASP  A  685  .  ?        ?  ?     
 33  1  1  A   38  CYS  A  686  .  ?        ?  ?     
 34  1  1  A   39  ALA  A  687  .  ?        ?  ?     
 35  1  1  A   40  GLY  A  688  .  ?        ?  ?     
 36  1  1  A   41  CYS  A  689  .  ?        ?  ?     
 37  1  1  A   42  ASN  A  690  .  ?        ?  ?     
 38  1  1  A   43  VAL  A  691  .  ?        ?  ?     
 39  1  1  A   44  GLU  A  692  .  ?        ?  ?     
 40  1  1  A   45  TYR  A  693  .  ?        ?  ?     
 41  1  1  A   46  GLN  A  694  .  ?        ?  ?     
 42  1  1  A   47  SER  A  695  .  ?        ?  ?     
 43  1  1  A   48  CYS  A  696  .  ?        ?  ?     
 44  1  1  A   49  ASN  A  697  .  ?        ?  ?     
 45  1  1  A   50  THR  A  698  .  ?        ?  ?     
 46  1  1  A   51  ASN  A  699  .  ?        ?  ?     
 47  1  1  A   52  PRO  A  700  .  ?        ?  ?     
 48  1  1  A   53  CYS  A  701  .  ?        ?  ?     
 49  1  1  A   54  PRO  A  702  .  ?        ?  ?     
 50  1  1  A   55  GLU  A  703  .  ?        ?  ?     
 51  1  1  A   56  LEU  A  704  .  ?        ?  ?     
 52  1  1  A   57  LYS  A  705  .  ?        ?  ?     
 53  1  1  A   58  LYS  A  706  .  ?        ?  ?     
 54  1  1  A   59  THR  A  707  .  ?        ?  ?     
 55  1  1  A   60  THR  A  708  .  ?        ?  ?     
 56  1  1  A   61  PRO  A  709  .  ?        ?  ?     
 57  1  1  A   62  TRP  A  710  .  ?        ?  ?     
 58  1  1  A   63  THR  A  711  .  ?        ?  ?     
 59  1  1  A   64  PRO  A  712  .  ?        ?  ?     
 60  1  1  A   65  TRP  A  713  .  ?        ?  ?     
 61  1  1  A   66  THR  A  714  .  ?        ?  ?     
 62  1  1  A   67  PRO  A  715  .  ?        ?  ?     
 63  1  1  A   68  VAL  A  716  .  ?        ?  ?     
 64  1  1  A   76  HIS  A  724  .  ?        ?  ?     
 65  1  1  A   77  TYR  A  725  .  ?        ?  ?     
 66  1  1  A   78  GLU  A  726  .  ?        ?  ?     
 67  1  1  A   79  GLN  A  727  .  ?        ?  ?     
 68  1  1  A   80  ARG  A  728  .  ?        ?  ?     
 69  1  1  A   81  PHE  A  729  .  ?        ?  ?     
 70  1  1  A   82  ARG  A  730  .  ?        1  ?     
 71  1  1  A   83  TYR  A  731  .  ?        ?  ?     
 72  1  1  A   84  THR  A  732  .  ?        ?  ?     
 73  1  1  A   85  CYS  A  733  .  ?        ?  ?     
 74  1  1  A   86  LYS  A  734  .  ?        ?  ?     
 75  1  1  A   87  ALA  A  735  .  ?        ?  ?     
 76  1  1  A   88  ARG  A  736  .  ?        ?  ?     
 77  1  1  A   89  LEU  A  737  .  ?        ?  ?     
 78  1  1  A   90  ALA  A  738  .  ?        ?  ?     
 79  1  1  A   91  ASP  A  739  .  ?        ?  ?     
 80  1  1  A   92  PRO  A  740  .  ?        ?  ?     
 81  1  1  A   93  ASN  A  741  .  ?        ?  ?     
 82  1  1  A   94  LEU  A  742  .  ?        ?  ?     
 83  1  1  A   95  LEU  A  743  .  ?        ?  ?     
 84  1  1  A   96  GLU  A  744  .  ?        ?  ?     
 85  1  1  A   97  VAL  A  745  .  ?        ?  ?     
 86  1  1  A   98  GLY  A  746  .  ?        ?  ?     
 87  1  1  A   99  ARG  A  747  .  ?        ?  ?     
 88  1  1  A  100  GLN  A  748  .  ?        ?  ?     
 89  1  1  A  101  ARG  A  749  .  ?        ?  ?     
 90  1  1  A  102  ILE  A  750  .  ?        ?  ?     
 91  1  1  A  103  GLU  A  751  .  ?        ?  ?     
 92  1  1  A  104  MET  A  752  .  ?        1  ?     
 93  1  1  A  105  ARG  A  753  .  ?        ?  ?     
 94  1  1  A  106  TYR  A  754  .  ?        ?  ?     
 95  1  1  A  107  CYS  A  755  .  ?        ?  ?     
 96  1  1  A  115  CYS  A  763  .  ?        ?  ?     
 97  1  1  B    6  MET  B  654  .  ?        ?  ?     
 98  1  1  B    7  PHE  B  655  .  ?        ?  ?     
 99  1  1  B    8  TRP  B  656  .  ?        ?  ?     
100  1  1  B    9  THR  B  657  .  ?        ?  ?     
101  1  1  B   10  GLY  B  658  .  ?        ?  ?     
102  1  1  B   11  TRP  B  659  .  ?        ?  ?     
103  1  1  B   12  GLY  B  660  .  ?        ?  ?     
104  1  1  B   13  PRO  B  661  .  ?        ?  ?     
105  1  1  B   14  TRP  B  662  .  ?        1  ?     
106  1  1  B   15  GLU  B  663  .  ?        ?  ?     
107  1  1  B   16  ARG  B  664  .  ?        ?  ?     
108  1  1  B   17  CYS  B  665  .  ?        ?  ?     
109  1  1  B   18  THR  B  666  .  ?        ?  ?     
110  1  1  B   19  ALA  B  667  .  ?        ?  ?     
111  1  1  B   20  GLN  B  668  .  ?        ?  ?     
112  1  1  B   21  CYS  B  669  .  ?        ?  ?     
113  1  1  B   22  GLY  B  670  .  ?        ?  ?     
114  1  1  B   23  GLY  B  671  .  ?        ?  ?     
115  1  1  B   24  GLY  B  672  .  ?        ?  ?     
116  1  1  B   25  ILE  B  673  .  ?        ?  ?     
117  1  1  B   26  GLN  B  674  .  ?        ?  ?     
118  1  1  B   27  ALA  B  675  .  ?        ?  ?     
119  1  1  B   28  ARG  B  676  .  ?        1  ?     
120  1  1  B   29  ARG  B  677  .  ?        ?  ?     
121  1  1  B   30  ARG  B  678  .  ?        ?  ?     
122  1  1  B   31  ILE  B  679  .  ?        ?  ?     
123  1  1  B   32  CYS  B  680  .  ?        ?  ?     
124  1  1  B   33  GLU  B  681  .  ?        ?  ?     
125  1  1  B   34  ASN  B  682  .  ?        ?  ?     
126  1  1  B   35  GLY  B  683  .  ?        ?  ?     
127  1  1  B   36  PRO  B  684  .  ?        ?  ?     
128  1  1  B   37  ASP  B  685  .  ?        2  ?     
129  1  1  B   38  CYS  B  686  .  ?        ?  ?     
130  1  1  B   39  ALA  B  687  .  ?        ?  ?     
131  1  1  B   40  GLY  B  688  .  ?        ?  ?     
132  1  1  B   41  CYS  B  689  .  ?        ?  ?     
133  1  1  B   42  ASN  B  690  .  ?        ?  ?     
134  1  1  B   43  VAL  B  691  .  ?        ?  ?     
135  1  1  B   44  GLU  B  692  .  ?        ?  ?     
136  1  1  B   45  TYR  B  693  .  ?        ?  ?     
137  1  1  B   46  GLN  B  694  .  ?        ?  ?     
138  1  1  B   47  SER  B  695  .  ?        ?  ?     
139  1  1  B   48  CYS  B  696  .  ?        ?  ?     
140  1  1  B   49  ASN  B  697  .  ?        ?  ?     
141  1  1  B   50  THR  B  698  .  ?        ?  ?     
142  1  1  B   51  ASN  B  699  .  ?        ?  ?     
143  1  1  B   52  PRO  B  700  .  ?        ?  ?     
144  1  1  B   53  CYS  B  701  .  ?        ?  ?     
145  1  1  B   54  PRO  B  702  .  ?        ?  ?     
146  1  1  B   55  GLU  B  703  .  ?        ?  ?     
147  1  1  B   56  LEU  B  704  .  ?        ?  ?     
148  1  1  B   57  LYS  B  705  .  ?        1  ?     
149  1  1  B   58  LYS  B  706  .  ?        ?  ?     
150  1  1  B   59  THR  B  707  .  ?        ?  ?     
151  1  1  B   60  THR  B  708  .  ?        ?  ?     
152  1  1  B   61  PRO  B  709  .  ?        ?  ?     
153  1  1  B   62  TRP  B  710  .  ?        1  ?     
154  1  1  B   63  THR  B  711  .  ?        ?  ?     
155  1  1  B   64  PRO  B  712  .  ?        ?  ?     
156  1  1  B   65  TRP  B  713  .  ?        ?  ?     
157  1  1  B   66  THR  B  714  .  ?        ?  ?     
158  1  1  B   67  PRO  B  715  .  ?        ?  ?     
159  1  1  B   68  VAL  B  716  .  ?        ?  ?     
160  1  1  B   69  ASN  B  717  .  ?        ?  ?     
161  1  1  B   76  HIS  B  724  .  ?        ?  ?     
162  1  1  B   77  TYR  B  725  .  ?        ?  ?     
163  1  1  B   78  GLU  B  726  .  ?        ?  ?     
164  1  1  B   79  GLN  B  727  .  ?        ?  ?     
165  1  1  B   80  ARG  B  728  .  ?        1  ?     
166  1  1  B   81  PHE  B  729  .  ?        ?  ?     
167  1  1  B   82  ARG  B  730  .  ?        ?  ?     
168  1  1  B   83  TYR  B  731  .  ?        ?  ?     
169  1  1  B   84  THR  B  732  .  ?        ?  ?     
170  1  1  B   85  CYS  B  733  .  ?        ?  ?     
171  1  1  B   86  LYS  B  734  .  ?        1  ?     
172  1  1  B   87  ALA  B  735  .  ?        ?  ?     
173  1  1  B   88  ARG  B  736  .  ?        ?  ?     
174  1  1  B   89  LEU  B  737  .  ?        ?  ?     
175  1  1  B   90  ALA  B  738  .  ?        ?  ?     
176  1  1  B   91  ASP  B  739  .  ?        ?  ?     
177  1  1  B   92  PRO  B  740  .  ?        ?  ?     
178  1  1  B   93  ASN  B  741  .  ?        ?  ?     
179  1  1  B   94  LEU  B  742  .  ?        ?  ?     
180  1  1  B   95  LEU  B  743  .  ?        ?  ?     
181  1  1  B   96  GLU  B  744  .  ?        ?  ?     
182  1  1  B   97  VAL  B  745  .  ?        ?  ?     
183  1  1  B   98  GLY  B  746  .  ?        ?  ?     
184  1  1  B   99  ARG  B  747  .  ?        ?  ?     
185  1  1  B  100  GLN  B  748  .  ?        ?  ?     
186  1  1  B  101  ARG  B  749  .  ?        ?  ?     
187  1  1  B  102  ILE  B  750  .  ?        ?  ?     
188  1  1  B  103  GLU  B  751  .  ?        ?  ?     
189  1  1  B  104  MET  B  752  .  ?        ?  ?     
190  1  1  B  105  ARG  B  753  .  ?        ?  ?     
191  1  1  B  106  TYR  B  754  .  ?        ?  ?     
192  1  1  B  107  CYS  B  755  .  ?        ?  ?     
193  1  1  B  108  SER  B  756  .  ?        ?  ?     
194  1  1  B  109  SER  B  757  .  ?        ?  ?     
195  1  1  B  110  ASP  B  758  .  ?        ?  ?     
196  1  1  B  111  GLY  B  759  .  ?        ?  ?     
197  1  1  B  112  THR  B  760  .  ?        ?  ?     
198  1  1  B  113  SER  B  761  .  ?        ?  ?     
199  1  1  B  114  GLY  B  762  .  ?        ?  ?     
200  1  1  B  115  CYS  B  763  .  ?        ?  ?     
201  1  1  B  116  SER  B  764  .  ?        ?  ?     
202  1  1  B  117  THR  B  765  .  ?        ?  ?     
203  1  1  B  118  GLY  B  766  .  ?        ?  ?     
204  1  1  B  119  THR  B  767  .  ?        ?  ?     
205  1  1  B  120  LEU  B  768  .  ?        ?  ?     
206  1  1  B  121  GLU  B  769  .  ?        ?  ?     
207  1  1  B  122  VAL  B  770  .  ?        ?  ?     
208  1  1  B  123  LEU  B  771  .  ?        ?  ?     
209  1  1  B  124  PHE  B  772  .  ?        ?  ?     
210  1  2  C    .  SO4  A  801  .  ?        ?  Y     
211  1  3  D    .  MAN  A  802  .  ?        ?  Y     
212  1  3  E    .  MAN  A  803  .  ?        ?  Y     
213  1  2  F    .  SO4  B  801  .  ?        ?  Y     
214  1  3  G    .  MAN  B  802  .  ?        ?  Y     
215  1  3  H    .  MAN  B  803  .  ?        ?  Y     
216  1  4  I    .  HOH  A  901  .  ?        1  ?     
217  1  4  I    .  HOH  A  902  .  ?        ?  ?     
218  1  4  I    .  HOH  A  903  .  ?        ?  ?     
219  1  4  I    .  HOH  A  904  .  ?        ?  ?     
220  1  4  I    .  HOH  A  905  .  ?        ?  ?     
221  1  4  I    .  HOH  A  906  .  ?        ?  ?     
222  1  4  I    .  HOH  A  907  .  ?        ?  ?     
223  1  4  I    .  HOH  A  908  .  ?        ?  ?     
224  1  4  I    .  HOH  A  909  .  ?        ?  ?     
225  1  4  I    .  HOH  A  910  .  ?        ?  ?     
226  1  4  I    .  HOH  A  911  .  ?        ?  ?     
227  1  4  I    .  HOH  A  912  .  ?        ?  ?     
228  1  4  I    .  HOH  A  913  .  ?        ?  ?     
229  1  4  I    .  HOH  A  914  .  ?        ?  ?     
230  1  4  I    .  HOH  A  915  .  ?        ?  ?     
231  1  4  I    .  HOH  A  916  .  ?        ?  ?     
232  1  4  I    .  HOH  A  917  .  ?        ?  ?     
233  1  4  I    .  HOH  A  918  .  ?        ?  ?     
234  1  4  I    .  HOH  A  919  .  ?        ?  ?     
235  1  4  I    .  HOH  A  920  .  ?        ?  ?     
236  1  4  I    .  HOH  A  921  .  ?        ?  ?     
237  1  4  I    .  HOH  A  922  .  ?        ?  ?     
238  1  4  I    .  HOH  A  923  .  ?        ?  ?     
239  1  4  I    .  HOH  A  924  .  ?        ?  ?     
240  1  4  I    .  HOH  A  925  .  ?        ?  ?     
241  1  4  I    .  HOH  A  926  .  ?        ?  ?     
242  1  4  I    .  HOH  A  927  .  ?        ?  ?     
243  1  4  I    .  HOH  A  928  .  ?        ?  ?     
244  1  4  I    .  HOH  A  929  .  ?        ?  ?     
245  1  4  I    .  HOH  A  930  .  ?        ?  ?     
246  1  4  I    .  HOH  A  931  .  ?        ?  ?     
247  1  4  I    .  HOH  A  932  .  ?        ?  ?     
248  1  4  I    .  HOH  A  933  .  ?        ?  ?     
249  1  4  I    .  HOH  A  934  .  ?        ?  ?     
250  1  4  I    .  HOH  A  935  .  ?        ?  ?     
251  1  4  I    .  HOH  A  936  .  ?        ?  ?     
252  1  4  I    .  HOH  A  937  .  ?        ?  ?     
253  1  4  I    .  HOH  A  938  .  ?        ?  ?     
254  1  4  I    .  HOH  A  939  .  ?        ?  ?     
255  1  4  I    .  HOH  A  940  .  ?        ?  ?     
256  1  4  I    .  HOH  A  941  .  ?        ?  ?     
257  1  4  I    .  HOH  A  942  .  ?        1  ?     
258  1  4  I    .  HOH  A  943  .  ?        ?  ?     
259  1  4  J    .  HOH  B  901  .  ?        ?  ?     
260  1  4  J    .  HOH  B  902  .  ?        ?  ?     
261  1  4  J    .  HOH  B  903  .  ?        ?  ?     
262  1  4  J    .  HOH  B  904  .  ?        ?  ?     
263  1  4  J    .  HOH  B  905  .  ?        ?  ?     
264  1  4  J    .  HOH  B  906  .  ?        ?  ?     
265  1  4  J    .  HOH  B  907  .  ?        ?  ?     
266  1  4  J    .  HOH  B  908  .  ?        ?  ?     
267  1  4  J    .  HOH  B  909  .  ?        ?  ?     
268  1  4  J    .  HOH  B  910  .  ?        ?  ?     
269  1  4  J    .  HOH  B  911  .  ?        ?  ?     
270  1  4  J    .  HOH  B  912  .  ?        ?  ?     
271  1  4  J    .  HOH  B  913  .  ?        ?  ?     
272  1  4  J    .  HOH  B  914  .  ?        ?  ?     
273  1  4  J    .  HOH  B  915  .  ?        ?  ?     
274  1  4  J    .  HOH  B  916  .  ?        ?  ?     
275  1  4  J    .  HOH  B  917  .  ?        ?  ?     
276  1  4  J    .  HOH  B  918  .  ?        ?  ?     
277  1  4  J    .  HOH  B  919  .  ?        ?  ?     
278  1  4  J    .  HOH  B  920  .  ?        ?  ?     
279  1  4  J    .  HOH  B  921  .  ?        ?  ?     
280  1  4  J    .  HOH  B  922  .  ?        ?  ?     
281  1  4  J    .  HOH  B  923  .  ?        ?  ?     
282  1  4  J    .  HOH  B  924  .  ?        ?  ?     
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161  161  ?             ?       ?  ?           1   5  0.33   7  0.45  molprobity  
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170  170  m        -100.7   128.2  Favored     4   6  0.21   8  0.61  molprobity  
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175  175  ?         -76.4   -31.2  Favored     5   5  0.34   7  0.39  molprobity  
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179  179  mt        -84.0    -1.4  Favored    11   8  0.34  11  0.40  molprobity  
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182  182  t         -95.0   130.1  Favored     9   7  0.45  10  0.61  molprobity  
183  183  ?         -80.5  -172.6  Favored     3   4  0.46   5  0.88  molprobity  
184  184  mtt85     -66.5   154.9  Favored    13  11  0.47  14  1.12  molprobity  
185  185  tt0       -75.2   132.4  Favored     8   9  0.40  12  0.46  molprobity  
186  186  mmt180   -113.7   134.9  Favored    13  11  0.36  14  0.96  molprobity  
187  187  mt       -119.9   129.2  Favored    11   8  0.28  11  0.40  molprobity  
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192  192  m        -101.8     9.0  Favored     4   6  0.65   8  0.88  molprobity  
193  193  p          72.2   174.5  Allowed     5   6  0.57   8  0.64  molprobity  
194  194  p         -70.4   -19.0  Favored     5   6  0.49   8  0.63  molprobity  
195  195  p30       -80.9   -11.3  Favored     4   8  0.52  11  1.13  molprobity  
196  196  ?          83.2     0.1  Favored     3   4  0.32   5  0.87  molprobity  
197  197  p        -135.1   -29.4  Allowed     7   7  0.28  10  0.93  molprobity  
198  198  m         -64.7   130.0  Favored     5   6  0.35   8  0.20  molprobity  
199  199  ?          79.5    -6.4  Favored     3   4  0.47   5  0.46  molprobity  
200  200  m        -113.7   -96.1  Allowed     4   6  1.27   8  1.44  molprobity  
201  201  p         -83.2   -12.9  Favored     5   6  0.31   8  0.48  molprobity  
202  202  p        -129.3   151.0  Favored     7   7  0.47  10  0.62  molprobity  
203  203  ?         -89.1  -174.8  Favored     3   4  0.51   5  0.82  molprobity  
204  204  p         -75.2   134.4  Favored     7   7  0.47  10  0.62  molprobity  
205  205  tp        -67.9   138.2  Favored    11   8  0.14  11  0.72  molprobity  
206  206  mt-10    -113.0   135.2  Favored     6   9  0.38  12  0.60  molprobity  
207  207  t        -127.8   123.3  Favored     9   7  0.29  10  0.52  molprobity  
208  208  tp        -93.7   118.2  Favored    11   8  0.36  11  0.37  molprobity  
209  209  m-85          ?       ?  ?           9  11  0.62  13  0.40  molprobity  
210  210  ?             ?       ?  ?           ?   4  0.13   6  0.20  mogul       
211  211  ?             ?       ?  ?          10  11  0.24  15  0.52  mogul       
212  212  ?             ?       ?  ?          10  11  0.22  15  0.57  mogul       
213  213  ?             ?       ?  ?           ?   4  0.24   6  0.25  mogul       
214  214  ?             ?       ?  ?          10  11  0.21  15  0.55  mogul       
215  215  ?             ?       ?  ?          10  11  0.24  15  0.66  mogul       
#
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_pdbx_vrpt_instance_clashes.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_clashes.instance_id
_pdbx_vrpt_instance_clashes.label_atom_id
_pdbx_vrpt_instance_clashes.cid
_pdbx_vrpt_instance_clashes.clashmag
_pdbx_vrpt_instance_clashes.dist
 1    6  CE3  1  0.53  2.44  
 2    9  CH2  2  0.56  2.41  
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17  216  O    4  0.54  2.39  
18  257  O    5  0.66  2.54  
#
loop_
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_pdbx_vrpt_software.name
_pdbx_vrpt_software.version
_pdbx_vrpt_software.success_y_or_n
1  molprobity   4.02b-467                                                             Y  
2  mogul        "1.8.4, CSD as541be (2020)"                                           Y  
3  dcc          '"2.27  (2023-04-10)"'                                                Y  
4  xtriage      1.13                                                                  Y  
5  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  Y  
##
