data_4A3N

loop_
_pdbx_vrpt_database.id
_pdbx_vrpt_database.code
PDB   4A3N       
PDBE  EBI-49866  
#
_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   x-ray
#
_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    4A3N
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2011-10-01
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         4
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2023-12-20
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2023-12-13:20:05
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,xtriage,eds,mogul,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   N
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer      "TRANSCRIPTION FACTOR SOX-17"  
2  non-polymer  "ZINC ION"  
3  water        water  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  2  
C  2  
D  2  
E  3  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all  x-ray  
2  2.4  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore           
2  Ramachandran_outlier_percent  
3  rotamer_outliers_percent      
4  RSRZ_outliers_percent         
5  R_value_R_free                
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
 1  1  1  10.20  141614     ?     ?  
 2  2  1  13.39    4398  2.40  2.40  
 3  1  2   9.39  138981     ?     ?  
 4  2  2  12.53    4318  2.40  2.40  
 5  1  3  58.54  138945     ?     ?  
 6  2  3  76.48    4319  2.40  2.40  
 7  1  4  48.56  127900     ?     ?  
 8  2  4  47.39    3811  2.40  2.40  
 9  1  5  19.18  130704     ?     ?  
10  2  5  27.80    3907  2.40  2.40  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A   9.39  
2  4  2  A  1  1  A  12.53  
3  5  3  A  1  1  A  58.54  
4  6  3  A  1  1  A  76.48  
5  7  4  A  1  1  A  48.56  
6  8  4  A  1  1  A  47.39  
#
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal          1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num    1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id        1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id    A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id     A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ      0.53
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ       0.42
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ   546
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ  733
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                        1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers  1.59
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_rotamer_outliers       1.79
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore                     18.66
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                   535
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                 546
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ                     0.42
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ                733
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                    0.53
#
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.exp_method                x-ray
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.ordinal                   1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Babinet_b                 101.372
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.bulk_solvent_b            63.965
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_estimate         27.675
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.I_over_sigma              8.40(2.31A)
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.num_miller_indices        4992
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Babinet_k                 0.281
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.bulk_solvent_k            0.318
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L_mean     0.492
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L2_mean    0.329
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Fo_Fc_correlation         0.934
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_R                     0.20
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_Rfree                 0.27
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_R                     0.22
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_res_high              2.30
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_res_low               23.66
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_aniso            "[44.481,22.661,26.314,-0.000,-11.217,0.000]"
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_anisotropy           0.700
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.trans_NCS_details         "The largest off-origin peak in the Patterson function is 13.14% of the height of the origin peak. No significant pseudotranslation is detected."
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.B_factor_type             FULL
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.acentric_outliers         1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.centric_outliers          0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_completeness         98.25
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.number_reflns_R_free      453
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.percent_free_reflections  9.07
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.percent_RSRZ_outliers     3.08
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_high       2.40
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_low        23.66
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_R                     0.20
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_Rfree                 0.27
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
_pdbx_vrpt_model_instance.count_symm_clashes
  1  1  1  A   5  ARG  A    70  .  ?        2     ?  
  2  1  1  A   6  PRO  A    71  .  ?        2     ?  
  3  1  1  A   7  MET  A    72  .  ?        1     ?  
  4  1  1  A   8  ASN  A    73  .  ?        ?     ?  
  5  1  1  A   9  ALA  A    74  .  ?        ?     ?  
  6  1  1  A  10  PHE  A    75  .  ?        ?     ?  
  7  1  1  A  11  MET  A    76  .  ?        1     ?  
  8  1  1  A  12  VAL  A    77  .  ?        ?     ?  
  9  1  1  A  13  TRP  A    78  .  ?        1     ?  
 10  1  1  A  14  ALA  A    79  .  ?        ?     ?  
 11  1  1  A  15  LYS  A    80  .  ?        ?     ?  
 12  1  1  A  16  ASP  A    81  .  ?        ?     ?  
 13  1  1  A  17  GLU  A    82  .  ?        1     ?  
 14  1  1  A  18  ARG  A    83  .  ?        ?     ?  
 15  1  1  A  19  LYS  A    84  .  ?        ?     ?  
 16  1  1  A  20  ARG  A    85  .  ?        ?     ?  
 17  1  1  A  21  LEU  A    86  .  ?        ?     ?  
 18  1  1  A  22  ALA  A    87  .  ?        ?     ?  
 19  1  1  A  23  GLN  A    88  .  ?        ?     ?  
 20  1  1  A  24  GLN  A    89  .  ?        2     ?  
 21  1  1  A  25  ASN  A    90  .  ?        6     1  
 22  1  1  A  26  PRO  A    91  .  ?        ?     ?  
 23  1  1  A  27  ASP  A    92  .  ?        2     1  
 24  1  1  A  28  LEU  A    93  .  ?        3     ?  
 25  1  1  A  29  HIS  A    94  .  ?        1     ?  
 26  1  1  A  30  ASN  A    95  .  ?        ?     ?  
 27  1  1  A  31  ALA  A    96  .  ?        ?     ?  
 28  1  1  A  32  GLU  A    97  .  ?        2     ?  
 29  1  1  A  33  LEU  A    98  .  ?        ?     ?  
 30  1  1  A  34  SER  A    99  .  ?        ?     ?  
 31  1  1  A  35  LYS  A   100  .  ?        ?     ?  
 32  1  1  A  36  MET  A   101  .  ?        1     ?  
 33  1  1  A  37  LEU  A   102  .  ?        ?     ?  
 34  1  1  A  38  GLY  A   103  .  ?        ?     ?  
 35  1  1  A  39  LYS  A   104  .  ?        ?     ?  
 36  1  1  A  40  SER  A   105  .  ?        ?     ?  
 37  1  1  A  41  TRP  A   106  .  ?        3     ?  
 38  1  1  A  42  LYS  A   107  .  ?        ?     ?  
 39  1  1  A  43  ALA  A   108  .  ?        ?     ?  
 40  1  1  A  44  LEU  A   109  .  ?        ?     ?  
 41  1  1  A  45  THR  A   110  .  ?        ?     ?  
 42  1  1  A  46  LEU  A   111  .  ?        ?     ?  
 43  1  1  A  47  ALA  A   112  .  ?        ?     ?  
 44  1  1  A  48  GLU  A   113  .  ?        ?     ?  
 45  1  1  A  49  LYS  A   114  .  ?        3     ?  
 46  1  1  A  50  ARG  A   115  .  ?        ?     ?  
 47  1  1  A  51  PRO  A   116  .  ?        ?     ?  
 48  1  1  A  52  PHE  A   117  .  ?        ?     ?  
 49  1  1  A  53  VAL  A   118  .  ?        1     ?  
 50  1  1  A  54  GLU  A   119  .  ?        ?     ?  
 51  1  1  A  55  GLU  A   120  .  ?        1     ?  
 52  1  1  A  56  ALA  A   121  .  ?        ?     ?  
 53  1  1  A  57  GLU  A   122  .  ?        1     ?  
 54  1  1  A  58  ARG  A   123  .  ?        ?     ?  
 55  1  1  A  59  LEU  A   124  .  ?        ?     ?  
 56  1  1  A  60  ARG  A   125  .  ?        ?     ?  
 57  1  1  A  61  VAL  A   126  .  ?        ?     ?  
 58  1  1  A  62  GLN  A   127  .  ?        1     ?  
 59  1  1  A  63  HIS  A   128  .  ?        ?     ?  
 60  1  1  A  64  MET  A   129  .  ?        ?     ?  
 61  1  1  A  65  GLN  A   130  .  ?        ?     ?  
 62  1  1  A  66  ASP  A   131  .  ?        ?     ?  
 63  1  1  A  67  HIS  A   132  .  ?        1     ?  
 64  1  1  A  68  PRO  A   133  .  ?        1     ?  
 65  1  1  A  69  ASN  A   134  .  ?        ?     ?  
 66  1  2  B   .  ZN   A  1135  .  ?        ?     ?  
 67  1  2  C   .  ZN   A  1136  .  ?        ?     ?  
 68  1  2  D   .  ZN   A  1137  .  ?        ?     ?  
 69  1  3  E   .  HOH  A  2001  .  ?        ?     ?  
 70  1  3  E   .  HOH  A  2002  .  ?        ?     ?  
 71  1  3  E   .  HOH  A  2003  .  ?        ?     ?  
 72  1  3  E   .  HOH  A  2004  .  ?        ?     ?  
 73  1  3  E   .  HOH  A  2005  .  ?        ?     ?  
 74  1  3  E   .  HOH  A  2006  .  ?        ?     ?  
 75  1  3  E   .  HOH  A  2007  .  ?        ?     ?  
 76  1  3  E   .  HOH  A  2008  .  ?        ?     ?  
 77  1  3  E   .  HOH  A  2009  .  ?        ?     ?  
 78  1  3  E   .  HOH  A  2010  .  ?        ?     ?  
 79  1  3  E   .  HOH  A  2011  .  ?        ?     ?  
 80  1  3  E   .  HOH  A  2012  .  ?        ?     ?  
 81  1  3  E   .  HOH  A  2013  .  ?        ?     ?  
 82  1  3  E   .  HOH  A  2014  .  ?        ?     ?  
 83  1  3  E   .  HOH  A  2015  .  ?        ?     ?  
 84  1  3  E   .  HOH  A  2016  .  ?        ?     ?  
 85  1  3  E   .  HOH  A  2017  .  ?        ?     ?  
 86  1  3  E   .  HOH  A  2018  .  ?        ?     ?  
 87  1  3  E   .  HOH  A  2019  .  ?        ?     ?  
 88  1  3  E   .  HOH  A  2020  .  ?        ?     ?  
 89  1  3  E   .  HOH  A  2021  .  ?        ?     ?  
 90  1  3  E   .  HOH  A  2022  .  ?        1     ?  
 91  1  3  E   .  HOH  A  2023  .  ?        ?     ?  
 92  1  3  E   .  HOH  A  2024  .  ?        ?     ?  
 93  1  3  E   .  HOH  A  2025  .  ?        ?     ?  
 94  1  3  E   .  HOH  A  2026  .  ?        ?     ?  
 95  1  3  E   .  HOH  A  2027  .  ?        ?     ?  
 96  1  3  E   .  HOH  A  2028  .  ?        ?     ?  
 97  1  3  E   .  HOH  A  2029  .  ?        ?     ?  
 98  1  3  E   .  HOH  A  2030  .  ?        ?     ?  
 99  1  3  E   .  HOH  A  2031  .  ?        ?     ?  
100  1  3  E   .  HOH  A  2032  .  ?        ?     ?  
101  1  3  E   .  HOH  A  2033  .  ?        ?     ?  
102  1  3  E   .  HOH  A  2034  .  ?        ?     ?  
103  1  3  E   .  HOH  A  2035  .  ?        ?     ?  
104  1  3  E   .  HOH  A  2036  .  ?        ?     ?  
105  1  3  E   .  HOH  A  2037  .  ?        ?     ?  
106  1  3  E   .  HOH  A  2038  .  ?        ?     ?  
107  1  3  E   .  HOH  A  2039  .  ?        ?     ?  
108  1  3  E   .  HOH  A  2040  .  ?        ?     ?  
109  1  3  E   .  HOH  A  2041  .  ?        ?     ?  
110  1  3  E   .  HOH  A  2042  .  ?        ?     ?  
111  1  3  E   .  HOH  A  2043  .  ?        ?     ?  
112  1  3  E   .  HOH  A  2044  .  ?        ?     ?  
113  1  3  E   .  HOH  A  2045  .  ?        ?     ?  
114  1  3  E   .  HOH  A  2046  .  ?        ?     ?  
115  1  3  E   .  HOH  A  2047  .  ?        1     ?  
116  1  3  E   .  HOH  A  2048  .  ?        ?     ?  
117  1  3  E   .  HOH  A  2049  .  ?        ?     ?  
118  1  3  E   .  HOH  A  2050  .  ?        ?     ?  
119  1  3  E   .  HOH  A  2051  .  ?        ?     ?  
120  1  3  E   .  HOH  A  2052  .  ?        ?     ?  
121  1  3  E   .  HOH  A  2053  .  ?        ?     ?  
122  1  3  E   .  HOH  A  2054  .  ?        ?     ?  
123  1  3  E   .  HOH  A  2055  .  ?        ?     ?  
124  1  3  E   .  HOH  A  2056  .  ?        ?     ?  
125  1  3  E   .  HOH  A  2057  .  ?        ?     ?  
126  1  3  E   .  HOH  A  2058  .  ?        ?     ?  
127  1  3  E   .  HOH  A  2059  .  ?        ?     ?  
128  1  3  E   .  HOH  A  2060  .  ?        ?     ?  
129  1  3  E   .  HOH  A  2061  .  ?        1     ?  
130  1  3  E   .  HOH  A  2062  .  ?        ?     ?  
131  1  3  E   .  HOH  A  2063  .  ?        ?     ?  
132  1  3  E   .  HOH  A  2064  .  ?        ?     ?  
133  1  3  E   .  HOH  A  2065  .  ?        ?     ?  
134  1  3  E   .  HOH  A  2066  .  ?        ?     ?  
135  1  3  E   .  HOH  A  2067  .  ?        ?     ?  
136  1  3  E   .  HOH  A  2068  .  ?        ?     ?  
137  1  3  E   .  HOH  A  2069  .  ?        ?     ?  
138  1  3  E   .  HOH  A  2070  .  ?        ?     ?  
139  1  3  E   .  HOH  A  2071  .  ?        ?     ?  
140  1  3  E   .  HOH  A  2072  .  ?        ?     ?  
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.ordinal
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.instance_id
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.rotamer_class
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.phi
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.psi
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.ramachandran_class
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.flippable_sidechain
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.num_H_reduce
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.OWAB
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.num_bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.num_angles_RMSZ
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.angles_RMSZ
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.program_for_bond_angle_geometry
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.average_occupancy
  1    1  ptm180        ?      ?  ?           ?    12  100.010    11  0.54    15  0.46  molprobity  1.000  
  2    2  Cg_endo   -70.3  158.6  Favored     ?     7   49.580     8  0.27    11  0.47  molprobity  1.000  
  3    3  mtm       -68.1  146.4  Favored     ?     9   37.230     8  0.60    10  1.07  molprobity  1.000  
  4    4  p30       -87.7  178.6  Favored     ?     6   30.890     8  0.30    11  0.54  molprobity  1.000  
  5    5  ?         -51.7  -46.5  Favored     ?     5   18.890     5  0.80     7  0.38  molprobity  1.000  
  6    6  t80       -60.5  -48.6  Favored     ?     9   31.590    12  0.80    16  0.27  molprobity  1.000  
  7    7  mtm       -60.6  -45.9  Favored     ?     9   31.950     8  0.47    10  0.79  molprobity  1.000  
  8    8  t         -55.1  -51.5  Favored     ?     9   27.660     7  0.43    10  0.60  molprobity  1.000  
  9    9  t90       -66.5  -37.0  Favored     ?    10   30.000    16  0.36    23  0.33  molprobity  1.000  
 10   10  ?         -67.6  -37.5  Favored     ?     5   33.300     5  0.22     7  0.57  molprobity  1.000  
 11   11  tttm      -43.1  -37.8  Favored     ?    13   61.780     9  0.35    11  0.49  molprobity  1.000  
 12   12  OUTLIER   -89.7  -39.5  Favored     ?     4   68.310     8  0.37    11  0.45  molprobity  1.000  
 13   13  mm-40     -66.3  -30.0  Favored     ?     6   54.540     9  0.25    12  0.32  molprobity  1.000  
 14   14  ttm105    -70.6  -50.1  Favored     ?    13   55.920    11  0.32    14  0.41  molprobity  1.000  
 15   15  mttp      -58.2  -39.8  Favored     ?    13   73.020     9  0.27    11  0.27  molprobity  1.000  
 16   16  ttp180    -65.3  -28.0  Favored     ?    13   55.390    11  0.24    14  0.56  molprobity  1.000  
 17   17  mt        -90.4  -36.6  Favored     ?    11   56.510     8  0.25    11  0.57  molprobity  1.000  
 18   18  ?         -78.4  -32.8  Favored     ?     5   67.350     5  0.20     7  0.27  molprobity  1.000  
 19   19  mt-30     -85.3   23.3  Allowed     ?     8  111.490     9  0.27    12  0.44  molprobity  1.000  
 20   20  mt-30    -140.4  -26.6  Allowed     ?     8   68.630     9  0.46    12  0.29  molprobity  1.000  
 21   21  m120     -129.2   84.6  Favored     1     6   52.180     8  0.46    12  0.61  molprobity  1.000  
 22   22  Cg_endo   -59.6  -27.8  Favored     ?     7   64.790     8  0.24    11  0.67  molprobity  1.000  
 23   23  p30       -85.8  -17.8  Favored     ?     4   58.550     8  0.34    11  0.53  molprobity  1.000  
 24   24  tt        -72.0  111.8  Favored     ?    11   48.490     8  0.25    11  0.55  molprobity  1.000  
 25   25  m170      -59.2  148.1  Favored     ?     7   39.190    11  0.16    15  0.39  molprobity  1.000  
 26   26  m-20      -62.1  -44.6  Favored     ?     6   69.050     8  0.20    11  0.49  molprobity  1.000  
 27   27  ?         -53.6  -46.4  Favored     ?     5   41.490     5  0.18     7  0.34  molprobity  1.000  
 28   28  tp10      -68.1  -35.4  Favored     ?     6   42.010     9  0.33    12  0.49  molprobity  1.000  
 29   29  tp        -59.2  -46.5  Favored     ?    11   48.620     8  0.26    11  0.82  molprobity  1.000  
 30   30  m         -63.6  -37.5  Favored     ?     5   43.620     6  0.44     8  0.39  molprobity  1.000  
 31   31  ttpt      -67.6  -44.0  Favored     ?    13   40.820     9  0.29    11  0.31  molprobity  1.000  
 32   32  mtp       -62.8  -47.1  Favored     ?     9   42.160     8  0.35    10  1.01  molprobity  1.000  
 33   33  mt        -58.9  -44.9  Favored     ?    11   29.830     8  0.27    11  0.51  molprobity  1.000  
 34   34  ?         -55.2  -44.0  Favored     ?     3   25.990     4  0.51     5  0.40  molprobity  1.000  
 35   35  mttt      -76.4  -37.3  Favored     ?    13   38.220     9  0.26    11  0.62  molprobity  1.000  
 36   36  m         -64.8  -39.6  Favored     ?     5   36.290     6  0.36     8  0.49  molprobity  1.000  
 37   37  t-105     -60.6  -44.9  Favored     ?    10   22.290    16  0.42    23  0.33  molprobity  1.000  
 38   38  tttt      -59.4  -43.7  Favored     ?    13   48.980     9  0.36    11  0.36  molprobity  1.000  
 39   39  ?         -65.0  -22.5  Favored     ?     5   34.820     5  0.22     7  0.33  molprobity  1.000  
 40   40  mt        -68.8  149.2  Favored     ?    11   33.410     8  0.35    11  0.82  molprobity  1.000  
 41   41  p         -90.9  159.9  Favored     ?     7   27.040     7  0.41    10  0.98  molprobity  1.000  
 42   42  tp        -52.3  -42.0  Favored     ?    11   27.440     8  0.22    11  0.44  molprobity  1.000  
 43   43  ?         -58.7  -31.8  Favored     ?     5   30.710     5  0.34     7  0.30  molprobity  1.000  
 44   44  mt-10     -85.4  -27.2  Favored     ?     6   27.120     9  0.83    12  0.58  molprobity  1.000  
 45   45  mtmt      -89.5  -18.5  Favored     ?    13   23.100     9  0.39    11  0.57  molprobity  1.000  
 46   46  tpp180    -38.9  -55.4  Favored     ?    13   29.760    11  0.37    15  0.72  molprobity  1.000  
 47   47  Cg_endo   -60.0  -33.5  Favored     ?     7   23.800     8  0.41    11  0.58  molprobity  1.000  
 48   48  m-85      -76.1  -32.2  Favored     ?     9   22.090    12  0.47    16  0.64  molprobity  1.000  
 49   49  t         -67.5  -41.0  Favored     ?     9   24.040     7  0.38    10  0.53  molprobity  1.000  
 50   50  mm-40     -68.2  -39.3  Favored     ?     6   39.920     9  0.31    12  0.34  molprobity  1.000  
 51   51  tp10      -62.7  -42.4  Favored     ?     6   38.930     9  0.38    12  0.50  molprobity  1.000  
 52   52  ?         -64.6  -35.7  Favored     ?     5   31.050     5  0.25     7  0.57  molprobity  1.000  
 53   53  mt-10     -67.2  -40.4  Favored     ?     6   57.190     9  0.28    12  0.31  molprobity  1.000  
 54   54  ttp85     -59.6  -52.5  Favored     ?    13   31.670    11  0.45    14  0.43  molprobity  1.000  
 55   55  mt        -55.6  -41.3  Favored     ?    11   24.790     8  0.47    11  0.40  molprobity  1.000  
 56   56  ttt-85    -62.9  -37.3  Favored     ?    13   43.560    11  0.44    14  0.48  molprobity  1.000  
 57   57  t         -62.9  -48.8  Favored     ?     9   31.370     7  0.39    10  0.50  molprobity  1.000  
 58   58  mm100     -59.3  -41.4  Favored     ?     8   42.210     9  0.42    12  0.36  molprobity  1.000  
 59   59  t60       -64.7  -45.8  Favored     ?     7   41.140    11  0.22    15  0.31  molprobity  1.000  
 60   60  mmt       -66.5  -20.5  Favored     ?     9   52.520     8  0.26    10  0.32  molprobity  1.000  
 61   61  mt-30     -94.1    6.4  Favored     ?     8   52.600     9  0.27    12  0.51  molprobity  1.000  
 62   62  t70        67.2   31.5  Favored     ?     4   42.710     8  0.36    11  0.62  molprobity  1.000  
 63   63  m-70       52.8   67.0  Favored     ?     7   45.660    11  0.18    16  0.56  molprobity  1.000  
 64   64  Cg_exo    -67.0  -62.6  OUTLIER     ?     7   72.560     8  1.44    10  0.61  molprobity  1.000  
 65   65  ?             ?      ?  ?           ?     ?   63.230     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 66   66  ?             ?      ?  ?           ?     ?   39.730     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 67   67  ?             ?      ?  ?           ?     ?   50.380     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 68   68  ?             ?      ?  ?           ?     ?   88.530     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 69   69  ?             ?      ?  ?           ?     ?   66.710     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 70   70  ?             ?      ?  ?           ?     ?   19.010     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 71   71  ?             ?      ?  ?           ?     ?   64.910     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 72   72  ?             ?      ?  ?           ?     ?   42.320     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 73   73  ?             ?      ?  ?           ?     ?   39.130     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 74   74  ?             ?      ?  ?           ?     ?   41.990     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 75   75  ?             ?      ?  ?           ?     ?   62.770     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 76   76  ?             ?      ?  ?           ?     ?   47.310     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 77   77  ?             ?      ?  ?           ?     ?   41.350     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 78   78  ?             ?      ?  ?           ?     ?   32.110     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 79   79  ?             ?      ?  ?           ?     ?   62.990     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 80   80  ?             ?      ?  ?           ?     ?   59.660     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 81   81  ?             ?      ?  ?           ?     ?   45.350     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 82   82  ?             ?      ?  ?           ?     ?   47.320     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 83   83  ?             ?      ?  ?           ?     ?   54.450     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 84   84  ?             ?      ?  ?           ?     ?   37.800     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 85   85  ?             ?      ?  ?           ?     ?   43.900     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 86   86  ?             ?      ?  ?           ?     ?   56.290     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 87   87  ?             ?      ?  ?           ?     ?   52.180     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 88   88  ?             ?      ?  ?           ?     ?   61.360     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 89   89  ?             ?      ?  ?           ?     ?   45.110     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 90   90  ?             ?      ?  ?           ?     ?   46.320     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 91   91  ?             ?      ?  ?           ?     ?   39.120     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 92   92  ?             ?      ?  ?           ?     ?   43.770     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 93   93  ?             ?      ?  ?           ?     ?   59.770     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 94   94  ?             ?      ?  ?           ?     ?   46.660     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 95   95  ?             ?      ?  ?           ?     ?   43.310     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 96   96  ?             ?      ?  ?           ?     ?   57.740     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 97   97  ?             ?      ?  ?           ?     ?   47.560     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 98   98  ?             ?      ?  ?           ?     ?   52.370     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 99   99  ?             ?      ?  ?           ?     ?   41.700     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
100  100  ?             ?      ?  ?           ?     ?   48.970     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
101  101  ?             ?      ?  ?           ?     ?   39.550     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
102  102  ?             ?      ?  ?           ?     ?   47.830     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
103  103  ?             ?      ?  ?           ?     ?   67.440     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
104  104  ?             ?      ?  ?           ?     ?   58.840     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
105  105  ?             ?      ?  ?           ?     ?   47.590     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
106  106  ?             ?      ?  ?           ?     ?   63.390     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
107  107  ?             ?      ?  ?           ?     ?   48.210     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
108  108  ?             ?      ?  ?           ?     ?   27.860     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
109  109  ?             ?      ?  ?           ?     ?   47.550     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
110  110  ?             ?      ?  ?           ?     ?   47.060     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
111  111  ?             ?      ?  ?           ?     ?   54.440     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
112  112  ?             ?      ?  ?           ?     ?   71.690     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
113  113  ?             ?      ?  ?           ?     ?   66.910     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
114  114  ?             ?      ?  ?           ?     ?   58.880     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
115  115  ?             ?      ?  ?           ?     ?   56.590     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
116  116  ?             ?      ?  ?           ?     ?   36.060     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
117  117  ?             ?      ?  ?           ?     ?   42.670     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
118  118  ?             ?      ?  ?           ?     ?   41.560     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
119  119  ?             ?      ?  ?           ?     ?   52.460     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
120  120  ?             ?      ?  ?           ?     ?   73.570     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
121  121  ?             ?      ?  ?           ?     ?   34.120     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
122  122  ?             ?      ?  ?           ?     ?   29.460     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
123  123  ?             ?      ?  ?           ?     ?   53.930     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
124  124  ?             ?      ?  ?           ?     ?   49.660     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
125  125  ?             ?      ?  ?           ?     ?   29.390     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
126  126  ?             ?      ?  ?           ?     ?   45.020     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
127  127  ?             ?      ?  ?           ?     ?   33.230     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
128  128  ?             ?      ?  ?           ?     ?   30.010     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
129  129  ?             ?      ?  ?           ?     ?   38.770     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
130  130  ?             ?      ?  ?           ?     ?   42.000     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
131  131  ?             ?      ?  ?           ?     ?   34.690     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
132  132  ?             ?      ?  ?           ?     ?   47.040     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
133  133  ?             ?      ?  ?           ?     ?   43.790     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
134  134  ?             ?      ?  ?           ?     ?   45.580     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
135  135  ?             ?      ?  ?           ?     ?   47.770     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
136  136  ?             ?      ?  ?           ?     ?   49.460     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
137  137  ?             ?      ?  ?           ?     ?   57.310     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
138  138  ?             ?      ?  ?           ?     ?   47.770     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
139  139  ?             ?      ?  ?           ?     ?   12.760     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
140  140  ?             ?      ?  ?           ?     ?   21.840     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_clashes.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_clashes.instance_id
_pdbx_vrpt_instance_clashes.label_atom_id
_pdbx_vrpt_instance_clashes.cid
_pdbx_vrpt_instance_clashes.clashmag
_pdbx_vrpt_instance_clashes.dist
 1    1  N      1  0.54  2.71  
 2    1  N      2  0.44  2.33  
 3    2  CD     1  0.54  2.71  
 4    2  HD3    2  0.44  2.33  
 5    3  HB3    3  0.54  1.90  
 6    7  HB2    3  0.54  1.90  
 7    9  CZ2    4  0.58  2.39  
 8   13  HG3    4  0.58  2.39  
 9   20  C      5  0.93  1.72  
10   20  C      6  0.57  2.52  
11   21  HD22   5  0.93  1.72  
12   21  HD22   7  0.50  2.01  
13   21  ND2    6  0.57  2.52  
14   21  ND2    8  0.48  2.61  
15   21  N      7  0.50  2.01  
16   21  N      8  0.48  2.61  
17   23  OD1    9  0.52  2.35  
18   23  N      9  0.52  2.35  
19   24  HD23  10  0.50  2.11  
20   24  HD23  11  0.48  2.35  
21   24  C     11  0.48  2.35  
22   25  O     10  0.50  2.11  
23   28  O     12  0.47  2.15  
24   28  HB2   13  0.41  2.20  
25   32  HG3   12  0.47  2.15  
26   37  CZ2   14  0.63  2.33  
27   37  CH2   15  0.58  2.38  
28   37  CE2   16  0.51  2.45  
29   45  HD2   14  0.63  2.33  
30   45  HD2   15  0.58  2.38  
31   45  HD2   16  0.51  2.45  
32   49  O     17  0.40  2.21  
33   51  CD    18  0.52  2.48  
34   53  HG3   17  0.40  2.21  
35   58  HG3   19  0.49  2.12  
36   63  N     20  0.40  2.37  
37   64  HD3   20  0.40  2.37  
38   90  O     13  0.41  2.20  
39  115  O     19  0.49  2.12  
40  129  O     18  0.52  2.48  
#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_symm_clashes.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_symm_clashes.instance_id
_pdbx_vrpt_instance_symm_clashes.label_atom_id
_pdbx_vrpt_instance_symm_clashes.scid
_pdbx_vrpt_instance_symm_clashes.symop
_pdbx_vrpt_instance_symm_clashes.clashmag
_pdbx_vrpt_instance_symm_clashes.dist
1  21  OD1  0  1_555  0.02  2.18  
2  23  OD1  0  2_555  0.02  2.18  
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance_density.ordinal
_pdbx_vrpt_model_instance_density.instance_id
_pdbx_vrpt_model_instance_density.natoms_eds
_pdbx_vrpt_model_instance_density.RSRCC
_pdbx_vrpt_model_instance_density.RSR
_pdbx_vrpt_model_instance_density.RSRZ
  1    1  11  0.558  0.482   3.960  
  2    2   7  0.915  0.173   0.391  
  3    3   8  0.938  0.094  -0.974  
  4    4   8  0.970  0.094  -0.969  
  5    5   5  0.966  0.104  -0.724  
  6    6  11  0.963  0.107  -0.858  
  7    7   8  0.968  0.089  -1.056  
  8    8   7  0.959  0.114  -0.769  
  9    9  14  0.968  0.108  -0.757  
 10   10   5  0.963  0.115  -0.546  
 11   11   9  0.888  0.196  -0.031  
 12   12   8  0.873  0.151  -0.165  
 13   13   9  0.904  0.132  -0.704  
 14   14  11  0.829  0.215   0.419  
 15   15   9  0.868  0.239   0.502  
 16   16  11  0.902  0.148  -0.469  
 17   17   8  0.869  0.204   0.589  
 18   18   5  0.835  0.237   1.431  
 19   19   9  0.707  0.395   2.980  
 20   20   9  0.573  0.266   1.224  
 21   21   8  0.824  0.164   0.059  
 22   22   7  0.796  0.206   0.906  
 23   23   8  0.835  0.159  -0.052  
 24   24   8  0.948  0.110  -0.945  
 25   25  10  0.953  0.091  -0.979  
 26   26   8  0.918  0.170   0.147  
 27   27   5  0.957  0.090  -0.951  
 28   28   9  0.962  0.105  -1.040  
 29   29   8  0.953  0.166  -0.031  
 30   30   6  0.970  0.103  -0.738  
 31   31   9  0.970  0.125  -0.911  
 32   32   8  0.962  0.130  -0.386  
 33   33   8  0.965  0.141  -0.439  
 34   34   4  0.958  0.105  -0.593  
 35   35   9  0.966  0.091  -1.332  
 36   36   6  0.943  0.092  -0.908  
 37   37  14  0.978  0.079  -1.300  
 38   38   9  0.956  0.132  -0.824  
 39   39   5  0.982  0.088  -0.984  
 40   40   8  0.957  0.128  -0.651  
 41   41   7  0.981  0.098  -0.877  
 42   42   8  0.956  0.116  -0.847  
 43   43   5  0.961  0.120  -0.465  
 44   44   9  0.963  0.116  -0.903  
 45   45   9  0.966  0.106  -1.146  
 46   46  11  0.942  0.157  -0.350  
 47   47   7  0.969  0.105  -0.672  
 48   48  11  0.969  0.129  -0.489  
 49   49   7  0.961  0.164   0.069  
 50   50   9  0.919  0.123  -0.816  
 51   51   9  0.962  0.127  -0.766  
 52   52   5  0.938  0.131  -0.287  
 53   53   9  0.894  0.203   0.178  
 54   54  11  0.946  0.119  -0.854  
 55   55   8  0.943  0.101  -1.091  
 56   56  11  0.920  0.199   0.207  
 57   57   7  0.952  0.132  -0.467  
 58   58   9  0.941  0.170  -0.082  
 59   59  10  0.956  0.115  -0.618  
 60   60   8  0.946  0.179   0.415  
 61   61   9  0.949  0.273   1.320  
 62   62   8  0.959  0.143  -0.277  
 63   63  10  0.968  0.143  -0.197  
 64   64   7  0.875  0.242   1.469  
 65   65   1  0.905  0.145  -0.220  
 66   66   1  0.979  0.076       ?  
 67   67   1  0.996  0.119       ?  
 68   68   1  0.956  0.073       ?  
 69   69   1  0.712  0.280       ?  
 70   70   1  0.958  0.091       ?  
 71   71   1  0.763  0.287       ?  
 72   72   1  0.942  0.131       ?  
 73   73   1  0.951  0.275       ?  
 74   74   1  0.847  0.264       ?  
 75   75   1  0.351  0.285       ?  
 76   76   1  0.897  0.136       ?  
 77   77   1  0.940  0.260       ?  
 78   78   1  0.889  0.295       ?  
 79   79   1  0.906  0.257       ?  
 80   80   1  0.693  0.396       ?  
 81   81   1  0.723  0.124       ?  
 82   82   1  0.959  0.296       ?  
 83   83   1  0.620  0.232       ?  
 84   84   1  0.929  0.091       ?  
 85   85   1  0.728  0.222       ?  
 86   86   1  0.709  0.110       ?  
 87   87   1  0.772  0.204       ?  
 88   88   1  0.765  0.222       ?  
 89   89   1  0.909  0.204       ?  
 90   90   1  0.868  0.193       ?  
 91   91   1  0.906  0.166       ?  
 92   92   1  0.951  0.130       ?  
 93   93   1  0.587  0.224       ?  
 94   94   1  0.894  0.263       ?  
 95   95   1  0.842  0.566       ?  
 96   96   1  0.679  0.346       ?  
 97   97   1  0.914  0.177       ?  
 98   98   1  0.839  0.185       ?  
 99   99   1  0.872  0.179       ?  
100  100   1  0.949  0.330       ?  
101  101   1  0.937  0.171       ?  
102  102   1  0.966  0.254       ?  
103  103   1  0.592  0.193       ?  
104  104   1  0.667  0.210       ?  
105  105   1  0.943  0.333       ?  
106  106   1  0.614  0.284       ?  
107  107   1  0.843  0.183       ?  
108  108   1  0.903  0.272       ?  
109  109   1  0.892  0.310       ?  
110  110   1  0.819  0.181       ?  
111  111   1  0.873  0.274       ?  
112  112   1  0.440  0.280       ?  
113  113   1  0.707  0.225       ?  
114  114   1  0.753  0.261       ?  
115  115   1  0.940  0.288       ?  
116  116   1  0.882  0.317       ?  
117  117   1  0.910  0.196       ?  
118  118   1  0.911  0.182       ?  
119  119   1  0.589  0.213       ?  
120  120   1  0.642  0.499       ?  
121  121   1  0.939  0.177       ?  
122  122   1  0.867  0.220       ?  
123  123   1  0.900  0.227       ?  
124  124   1  0.814  0.151       ?  
125  125   1  0.961  0.140       ?  
126  126   1  0.887  0.355       ?  
127  127   1  0.953  0.220       ?  
128  128   1  0.933  0.140       ?  
129  129   1  0.939  0.154       ?  
130  130   1  0.918  0.232       ?  
131  131   1  0.973  0.169       ?  
132  132   1  0.949  0.522       ?  
133  133   1  0.951  0.173       ?  
134  134   1  0.958  0.255       ?  
135  135   1  0.682  0.461       ?  
136  136   1  0.864  0.217       ?  
137  137   1  0.918  0.236       ?  
138  138   1  0.778  0.133       ?  
139  139   1  0.986  0.118       ?  
140  140   1  0.989  0.121       ?  
#
loop_
_pdbx_vrpt_software.ordinal
_pdbx_vrpt_software.name
_pdbx_vrpt_software.version
_pdbx_vrpt_software.success_y_or_n
1  molprobity   4.02b-467                                                             Y  
2  mogul        unknown                                                               Y  
3  eds          2.36                                                                  Y  
4  dcc          '"2.27  (2023-04-10)"'                                                Y  
5  xtriage      1.13                                                                  Y  
6  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  Y  
##
